A virus detection network to stop the next pandemic | Pardis Sabeti and Christian Happi

Nagekeken door: Tahlia Flora

[In januari 2020 presenteerden

Christian Happi en Pardis Sabeti een gedurfd idee

Sentinel: Een systeem om vroegtijdig de volgende pandemie te voorspellen

[In January 2020,

Christian Happi and Pardis Sabeti presented an Audacious idea]

Zo zou het kunnen werken ...]

[Sentinel: An early warning system to detect and track the next pandemic]

Christian Happi: Sentinel is een proactief vroeg waarschuwingssysteem

om pandemieën te voorkomen.

[Here's how it would work ...]

Het is gebaseerd op drie grote pijlers.

Christian Happi: Sentinel is a proactive early warning system to preempt pandemics.

Pardis Sabeti: De eerste pijler is Detect.

Christian en ik onderzochten besmettelijke ziektes over de hele wereld

gedurende twee decennia.

It is built on three major pillars.

Wij gebruiken genoomsequencing.

Pardis Sabeti: The first pillar is Detect.

Door alle genetische informatie van een microbe te lezen,

Christian and I have been studying infectious diseases together

kunnen we virussen identificeren, zelfs als we ze nog nooit gezien hebben,

around the world for two decades.

We have been using genome sequencing.

ze traceren,

Reading out the complete genetic information of a microbe,

en uitkijken voor nieuwe mutaties.

En nu met de krachtige genbewerkingstechnologie CRISPR,

it allows us to identify viruses, even those we've never seen before,

kunnen we deze genetische informatie gebruiken

track them as they spread

om snel verfijnde en gevoelige testen voor iedere microbe te ontwerpen.

and watch for new mutations.

And now with the powerful gene-editing technology CRISPR,

we can use this genetic information

CH: Een van deze hulpmiddelen is SHERLOCK.

to rapidly design exquisitely sensitive diagnostic tests for any microbe.

Het kan gebruikt worden om gekende virussen te testen

op eenvoudige papierstroken.

CH: One of these tools is called SHERLOCK.

Het is zeer goedkoop

en eerstelijns medisch personeel kan SHERLOCK gebruiken

It can be used to test known viruses on simple paper strips.

om de meest voorkomende of meest gevaarlijke virussen

It is very inexpensive,

binnen een uur te detecteren.

and frontline health workers can use SHERLOCK

PS: CARMEN is nog een hulpmiddel.

to detect the most common or the most threatening viruses

Het vereist een lab, maar het kan honderden virussen tegelijk testen.

Laboranten in een ziekenhuis kunnen monsters testen

within an hour.

PS: The other tool is CARMEN.

op een breed spectrum aan virussen

It requires a lab, but it can test for hundreds of viruses simultaneously.

binnen een dag.

Onze tweede pijler is Connect.

So hospital lab staff can test patient samples

Verbind iedereen en deel deze informatie

for a broad range of viruses

over de medische wereld.

within a day.

Our second pillar is Connect.

Tijdens de meeste uitbraken

delen ziekenhuismedewerkers dossiers via papier, Excel -- of gewoon niet.

Connect everyone and share this information

across the public health community.

Dit maakt het extreem moeilijk

In most outbreaks,

om een uitbraak te traceren en een afgestemde oplossing te vinden.

hospital staff share case information through paper, Excel -- if at all.

Daarom ontwikkelen wij een cloudgebaseerd systeem en mobiele apps

This makes tracking an outbreak through space and time

voor medische staf, clinici,

and coordinating a response

medewerkers bij volksgezondheid, iedereen,

extremely difficult.

So we're developing a cloud-based system and mobile applications

om data te uploaden

analyses te maken, inzichten te delen

that connect community health workers,

en samen een onvertraagde reactie te geven met een plan-van-aanpak.

clinicians, public health teams -- everyone --

and allows them to upload data,

Een derde pijler is Empower.

perform analysis, share insights

Een systeem voor toezicht op uitbraken kan alleen slagen

and coordinate a response and action plan

als we de eerstelijnsmedewerkers die al betrokken zijn

in real time.

CH: Our third pillar is Empower.

hulpmiddelen geven.

An outbreak surveillance system can only succeed

Het vereist veel training.

Dat beseffen Pardis en ik.

if we empower frontline health workers that are already out there

We hebben de afgelopen tien jaar honderden jonge Afrikaanse wetenschappers

taking care of communities.

It requires a lot of training.

en clinici getraind.

De komende vijf jaar zullen we 1.000 extra zorgmedewerkers trainen

Pardis and I are very much aware of that.

We've spent the past 10 years

training hundreds of young African scientists and clinicians.

om het Sentinel-hulpmiddel te gebruiken

en ze in staat te stellen om hun collega's te trainen.

Over the next five years, we will train an additional 1,000 health workers

Op deze manier zullen we het huidige zorgsysteem verbeteren

to use Sentinel detection tools

en meer controle krijgen over medische handelingen.

and empower them to train their colleagues.

This way, we will improve the original health care system

[Sinds ze het gedurfde idee aan TED gepresenteerd hebben,

is de wereld veranderd ...]

and integrate surveillance into medical practice.

Briar Goldberg: Hier zijn we dan.

We nemen het op.

Het is 7 april 2020,

[Since presenting their Audacious plan at TED, the world has changed ...]

en het is duidelijk dat we leven tijdens een gekke wereldwijde pandemie,

Briar Goldberg: So here we are. We're recording this.

veroorzaakt door het nieuwe coronavirus.

It's April 7th, 2020,

Dus jullie twee hebben al een eeuwigheid samengewerkt

and obviously, we are in the throes of this crazy global pandemic

en jullie zijn vrij abrupt bij elkaar gekomen

door de Ebolacrisis in 2014.

caused by this new coronavirus.

So you two have been working together forever,

Hoe ervaren jullie dit?

and you really came together pretty aggressively

CH: Ongeveer zes jaar na de Ebola-uitbraak

with the Ebola crisis back in 2014.

worden we geconfronteerd met een nieuwe crisis

en hebben we nagenoeg niks geleerd uit de vorige crisis.

What does it feel like from your perspective?

CH: Pretty much six years after the Ebola outbreak,

we're really facing another crisis,

Dat is voor mij echt hartbrekend.

PS: Ik denk dat deze pandemie ons heeft laten zien

and we still pretty much, like, we never learned from the previous crisis.

hoe onvoorbereid we zijn wereldwijd.

And that, really, for me, is heartbreaking.

Christian en onze partners hadden in onze ziekenhuizen

PS: I think that this pandemic has shown us how unprepared we are

in Nigeria, Sierra Leona en Senegal begin februari al diagnoses gesteld.

everywhere in the world.

De meeste staten in Amerika hadden dit pas veel later.

Christian and our partners together had diagnostics at our hospital sites

in Nigeria, Sierra Leone and Senegal in early February.

Het leert ons dat we allemaal in hetzelfde schuitje zitten

Most states in the United States didn't have it until far later.

en dat we allemaal achterlopen op de curve.

BG: Dit Sentinel-systeem is fantastisch,

It tells us that we are all in this together,

maar ik weet dat iedereen nu denkt:

and we are all very much behind the curve.

hoe is dat hier en nu van toepassing?

BG: So, this Sentinel system is amazing,

PS: We omschrijven Sentinel als een voorspeller van pandemieën,

en hier zijn we in een pandemie.

but I know that the question that's on everybody's mind is:

Maar dezelfde hulpmiddelen die je nodig hebt

How is that playing into the here and now?

om dit te voorkomen,

PS: You know, we describe Sentinel as a pandemic preemption system,

zijn degene waarmee je reageert op een pandemie.

Dus alle technologie die wij beschikbaar stellen −

and here we are in a pandemic.

But what's great is that, actually, the same tools you need

het aandachtspunt testen, het multiplex testen,

to preempt a pandemic

het ontdekken en traceren van het virus terwijl het verandert

are the ones that you need to respond to one.

And so all of the technologies that we have laid out --

en de visualisering van apps naar dashboards −

the point-of-care testing, the multiplex testing,

zijn allemaal onmisbaar.

CH: Voor ons is het een oorlog.

the discovery and tracking of the virus as it's changing,

We zijn 24 uur per dag toegewijd

and the overlay of the mobile applications to dashboard --

om resultaten te kunnen boeken

are all critical.

en dat vergt van ons dat we non-stop rond de klok werken.

CH: For us, it is a war.

We are basically committed for 24 hours' turnaround time

Het is dus een grote uitdaging.

in order to give results,

We zijn niet bij familie.

Vandaag kan ik mijn familie nog zien,

and that requires for us to work around the clock nonstop.

maar morgen ga ik zeker terug de loopgraven in.

So it's a pretty challenging moment.

In mijn lab hebben we het eerste COVID-19 genoom

We are away from family.

At least I have the privilege to see family today,

van Afrika gesequenced.

En dat is gelukt binnen 48 uur.

and then I'm sure tomorrow I'm heading back in the trenches.

Voor Afrika is dit revolutionair

In my lab, we sequenced the first COVID-19 genome

om die informatie beschikbaar te stellen voor de wereldwijde gezondheidszorg

on the African continent,

and that really was done within 48 hours.

en te laten zien hoe het virus in Afrika is.

This is revolutionary coming from Africa

Ik geloof in technologie en kennis

and then making this information available for the global health community

en als we informatie delen

kunnen we ons verbeteren en dit overwinnen.

to see what the virus within Africa looks like.

PS: Het idee achter Sentinel

I believe that with technologies and knowledge

is dat we klaar staan voor elkaar.

and then sharing information,

We kijken allemaal toe.

Elk van ons is een schildwacht.

we can do better and then we can overcome.

Elk van ons, die kan monitoren wat ons ziek maakt,

PS: The whole idea of Sentinel

is that we all stand guard over each other.

kan dat delen met de rest van onze gemeenschap.

We all watch.

Each one of us is a sentinel.

Dat is denk ik wat ik echt wilde.

Each one of us, being able to monitor what is making us sick,

Om allemaal op wacht te staan

en over elkaar te waken.

can share that with the rest of our community.

[Dr. Pardis Sabeti en Dr. Christian Happi

And I think that is what I profoundly want,

Ingenieuze wetenschappers.

is for us to all stand guard

Moedige partners.

and watch over each other.

Wereldwijde helden.]

[Dr. Pardis Sabeti and Dr. Christian Happi]

[Ingenious scientists.

Courageous partners.

Global heroes.]