A virus detection network to stop the next pandemic | Pardis Sabeti and Christian Happi

Traducteur: Domitilla Luciani Relecteur: Alessia Patanè

[In January 2020,

[En janvier 2020

Christian Happi and Pardis Sabeti presented an Audacious idea]

Christian Happi et Pardis Sabeti ont présenté leur idée « Audacious »]

[Sentinel: An early warning system to detect and track the next pandemic]

[Sentinel : système d'alerte précoce pour détecter et suivre la prochaine pandémie]

[Voici ses mécanismes ...]

[Here's how it would work ...]

Christian Happi: Sentinel is a proactive early warning system to preempt pandemics.

Christian Happi : Sentinel est un système proactif pour prévenir les pandémies.

It is built on three major pillars.

Il repose sur trois piliers majeurs.

Pardis Sabeti: The first pillar is Detect.

Pardis Sabeti : Le premier est la détection.

Christian and I have been studying infectious diseases together

Christian et moi avons étudié les maladies infectieuses

around the world for two decades.

à travers le monde pendant 20 ans.

We have been using genome sequencing.

Nous utilisons le séquençage du génome.

Reading out the complete genetic information of a microbe,

Lire l'infomation génétique integrale d'un microbe

it allows us to identify viruses, even those we've never seen before,

nous permet d'identifier les virus, même ceux dont nous ignorons l'existence,

track them as they spread

de cartographier leur diffusion

and watch for new mutations.

et de surveiller leur mutations.

And now with the powerful gene-editing technology CRISPR,

Avec la nouvelle méthode de manipulation du génome CRISPR,

we can use this genetic information

nous pouvons utiliser l'information génétique

to rapidly design exquisitely sensitive diagnostic tests for any microbe.

pour concevoir rapidement des tests de diagnostic pour les microbes.

CH: One of these tools is called SHERLOCK.

CH : L'un de ces outils s'appelle SHERLOCK

It can be used to test known viruses on simple paper strips.

et peut tester des virus connus avec de simples papiers indicateurs.

It is very inexpensive,

C'est très bon marché,

and frontline health workers can use SHERLOCK

le corps médical en premier ligne peut utiliser SHERLOCK

to detect the most common or the most threatening viruses

afin de détecter les virus les plus connus ou bien les plus dangereux

within an hour.

en une heure.

PS: The other tool is CARMEN.

PS : l'autre outil est CARMEN.

It requires a lab, but it can test for hundreds of viruses simultaneously.

Il nécessite un labo, mais il peut tester des centaines des virus au même temps.

L'équipe médicale peut tester les échantillons des patients

So hospital lab staff can test patient samples

for a broad range of viruses

pour une large gamme de virus en un jour.

within a day.

Our second pillar is Connect.

Notre deuxième pilier est la connexion.

Connect everyone and share this information

Connecter tout le monde et partager les infos

across the public health community.

dans la communauté de la santé publique.

In most outbreaks,

Dans beaucoup d'épidémies,

hospital staff share case information through paper, Excel -- if at all.

Les infos des cas sont partagés sur papier, fichier Excel, ou pas du tout.

Cela rend le suivi spatio-temporel d'un épidémie

This makes tracking an outbreak through space and time

and coordinating a response

et la coordination d'une réponse extrêmement difficile.

extremely difficult.

So we're developing a cloud-based system and mobile applications

Nous développons donc un système basé sur le cloud et les applis mobiles

that connect community health workers,

qui connecte les agents de soin de santé,

clinicians, public health teams -- everyone --

cliniciens, équipes médicales publiques, bref, tout le monde,

and allows them to upload data,

et leur permet de télécharger les données,

perform analysis, share insights

effectuer des analyses, partager des aperçus

and coordinate a response and action plan

et se coordonner en temps réel réponse et plan d'action.

in real time.

CH: Our third pillar is Empower.

CH : Notre troisième pilier est la valorisation.

An outbreak surveillance system can only succeed

Un système de surveillance des épidémies réussit en valorisant le corps médical

if we empower frontline health workers that are already out there

qui se trouve en primer ligne pour soigner les communautés.

taking care of communities.

It requires a lot of training.

Cela demande beaucoup de formation.

Pardis and I are very much aware of that.

Pardis et moi en sommes très conscients.

We've spent the past 10 years

Nous avons passé les 10 dernières années

training hundreds of young African scientists and clinicians.

à former des centaines de jeunes scientifiques et cliniciens africains.

Over the next five years, we will train an additional 1,000 health workers

D'ici 5 ans, nous allons former 1 000 agents de la santé supplémentaires

to use Sentinel detection tools

à l'utilisation des outils de détection de Sentinel

and empower them to train their colleagues.

et nous allons leur donner les outils pédagogiques pour former leurs collègues.

This way, we will improve the original health care system

On améliorera ainsi le système de santé

and integrate surveillance into medical practice.

et on intégrera la surveillance dans la pratique médicale.

[Since presenting their Audacious plan at TED, the world has changed ...]

[Depuis la conférence TED qui présente ce plan Audacious, le monde a changé ...]

Briar Goldberg: So here we are. We're recording this.

Briar Goldberg : Nous voilà donc et on enregistre.

It's April 7th, 2020,

Nous sommes le 7 avril 2020,

and obviously, we are in the throes of this crazy global pandemic

et évidemment, nous sommes en proie à cette pandémie mondiale inimaginable

caused by this new coronavirus.

causée par ce nouveau coronavirus.

So you two have been working together forever,

Vous avez toujours travaillé ensemble

and you really came together pretty aggressively

et votre réponse fut assez incisive au moment de la crise d'Ebola en 2014.

with the Ebola crisis back in 2014.

What does it feel like from your perspective?

Que ressentez-vous de votre point de vue ?

CH: Pretty much six years after the Ebola outbreak,

CH : Environ six ans après l'épidemie d'Ebola,

we're really facing another crisis,

nous faisons face à une autre crise.

and we still pretty much, like, we never learned from the previous crisis.

C'est comme si nous n'avions rien appris de la crise précédente.

And that, really, for me, is heartbreaking.

Je trouve ça déchirant.

PS: I think that this pandemic has shown us how unprepared we are

PS : Je pense que cette pandémie nous a montré

combien le monde n'était pas préparé.

everywhere in the world.

Christian and our partners together had diagnostics at our hospital sites

Christian et nos partenaires avaient des cas diagnostiqués dans nos hôpitaux

in Nigeria, Sierra Leone and Senegal in early February.

au Nigéria, en Sierra Leone et au Sénégal début février.

Most states in the United States didn't have it until far later.

La plupart des États aux États-Unis n'en ont eu que bien plus tard.

It tells us that we are all in this together,

Cela nous dit que nous sommes tous dans le même bateau

and we are all very much behind the curve.

et nous sommes tous très en retard.

BG: So, this Sentinel system is amazing,

BG : Donc le système Sentinel est génial

but I know that the question that's on everybody's mind is:

mais je sais que tout le monde se demande :

How is that playing into the here and now?

Quelle est son action ici et maintenant ?

PS: You know, we describe Sentinel as a pandemic preemption system,

PS : Sentinel est un système d'alerte des pandémies,

et c'est ce que nous vivons aujourd'hui.

and here we are in a pandemic.

But what's great is that, actually, the same tools you need

Ce qui est génial, c'est que les outils nécessaires pour éviter une pandémie

to preempt a pandemic

sont les même que ceux pour y répondre.

are the ones that you need to respond to one.

Et donc toutes les technologies que nous avons présentées,

And so all of the technologies that we have laid out --

the point-of-care testing, the multiplex testing,

Les tests sur le lieu de soins, le test Multiplex

the discovery and tracking of the virus as it's changing,

la découverte et le traçage du virus durant son évolution

and the overlay of the mobile applications to dashboard --

et le remplacement des tableaux de bord avec des applis --

are all critical.

sont toutes cruciales.

CH: For us, it is a war.

CH : Pour nous, c'est une guerre.

We are basically committed for 24 hours' turnaround time

Nous sommes engagés 24 heures sur 24 pour donner des résultats,

in order to give results,

and that requires for us to work around the clock nonstop.

et cela nous oblige à travailler 24h/24 sans relâche.

So it's a pretty challenging moment.

C'est donc un moment très difficile à vivre.

We are away from family.

Nous sommes éloignés de nos familles.

At least I have the privilege to see family today,

J'ai le privilège de voir la mienne aujourd'hui,

and then I'm sure tomorrow I'm heading back in the trenches.

mais demain, je vais retourner sur le terrain.

In my lab, we sequenced the first COVID-19 genome

Dans mon labo, on a séquencé le premier génome COVID-19

on the African continent,

sur le continent africain, et cela a été fait en 48 heures.

and that really was done within 48 hours.

This is revolutionary coming from Africa

C'est révolutionnaire sur notre continent.

and then making this information available for the global health community

Nous allons donnez accès à ces données à la communauté internationale

pour voir à quoi ressemble le virus en Afrique.

to see what the virus within Africa looks like.

I believe that with technologies and knowledge

Avec les technologies, la connaissance et le partage des données,

and then sharing information,

we can do better and then we can overcome.

nous pouvons faire mieux et vaincre la pandémie.

PS: The whole idea of Sentinel

PS : L'idée centrale de Sentinel est la surveillance mutuelle,

is that we all stand guard over each other.

We all watch.

En surveillant notre santé mutuelle, chacun devient une sentinelle.

Each one of us is a sentinel.

Each one of us, being able to monitor what is making us sick,

Chacun est capable de comprendre ce que nous rend malade

can share that with the rest of our community.

et peut le partager avec toute la communauté.

And I think that is what I profoundly want,

C'est mon vœu le plus cher :

is for us to all stand guard

c'est que nous soyons vigilant et prenions soin les uns des autres.

and watch over each other.

[Dr. Pardis Sabeti and Dr. Christian Happi]

[Dre Pardis Sabeti et Dr Christian Happi]

[Ingenious scientists.

[Scientifiques perspicaces.

Courageous partners.

Partenaires courageux.

Global heroes.]

Héros mondiaux.]