A virus detection network to stop the next pandemic | Pardis Sabeti and Christian Happi

Översättare: Rebecca Snäckerström Granskare: Lisbeth Pekkari

[In January 2020,

[I januari 2020

Christian Happi and Pardis Sabeti presented an Audacious idea]

presenterade Christian Happi och Pardis Sabeti en vågad idé]

[Sentinel: An early warning system to detect and track the next pandemic]

[Sentinel: Ett varningssystem för att upptäcka och spåra nästa pandemi]

[Here's how it would work ...]

[Så här skulle det fungera...]

Christian Happi: Sentinel is a proactive early warning system to preempt pandemics.

Christian Happi: Sentinel är ett proaktivt varningssystem för att förekomma pandemier.

It is built on three major pillars.

Det är uppbyggt av tre grundpelare.

Pardis Sabeti: The first pillar is Detect.

Pardis Sabeti: Den första är Upptäckt.

Christian and I have been studying infectious diseases together

Christian och jag har studerat smittsamma sjukdomar tillsammans

around the world for two decades.

runtom i världen under två årtionden.

We have been using genome sequencing.

Vi har använt oss av genomsekvensering.

Reading out the complete genetic information of a microbe,

Att läsa ut den genetiska informationen hos en mikrob,

it allows us to identify viruses, even those we've never seen before,

tillåter oss att identifiera virus, inklusive de vi inte sett tidigare,

track them as they spread

spåra dem när de sprider sig och observera nya mutationer.

and watch for new mutations.

And now with the powerful gene-editing technology CRISPR,

Och nu med den kraftfulla gen-redigerande teknologin CRISPR,

we can use this genetic information

kan vi använda den genetiska informationen

to rapidly design exquisitely sensitive diagnostic tests for any microbe.

för att snabbt designa finkänsliga diagnostiska tester för alla mikrober.

CH: One of these tools is called SHERLOCK.

CH: Ett av dessa verktyg heter SHERLOCK.

It can be used to test known viruses on simple paper strips.

Det används för att testa kända virus på enkla pappersremsor.

It is very inexpensive,

Det är väldigt billigt,

and frontline health workers can use SHERLOCK

och sjukvårdsarbetare på frontlinjen kan använda SHERLOCK

to detect the most common or the most threatening viruses

för att upptäcka de vanligaste eller mest hotfulla virusen

within an hour.

inom en timme.

PS: The other tool is CARMEN.

PS: Nästa verktyg är CARMEN.

It requires a lab, but it can test for hundreds of viruses simultaneously.

För det behövs ett labb, men det kan testa för hundratals virus samtidigt.

So hospital lab staff can test patient samples

Så att labbpersonal på sjukhus kan testa patientprov

for a broad range of viruses

för en bred samling virus inom en dag.

within a day.

Our second pillar is Connect.

Vår andra pelare är Förena.

Connect everyone and share this information

Att förena alla och dela informationen med hela folkhälsosamhället.

across the public health community.

In most outbreaks,

Vid de flesta utbrotten,

hospital staff share case information through paper, Excel -- if at all.

delar sjukvårdspersonal information om fall genom papper, Excel - om alls.

This makes tracking an outbreak through space and time

Det gör spårning av ett utbrott genom tid och rum

and coordinating a response

och samordning av ett gensvar extremt svårt.

extremely difficult.

So we're developing a cloud-based system and mobile applications

Så vi utvecklar ett molnbaserat system och mobila applikationer

that connect community health workers,

som förenar samhällens sjukvårdspersonal,

clinicians, public health teams -- everyone --

kliniker, hälsovårdslag - alla -

and allows them to upload data,

och tillåter dem att ladda upp data,

perform analysis, share insights

genomföra analyser, dela insikter

and coordinate a response and action plan

och koordinera gensvar och handlingsplan i realtid.

in real time.

CH: Our third pillar is Empower.

CH: Vår tredje pelare är Stärka.

An outbreak surveillance system can only succeed

Ett övervakningssystem för utbrott kan bara lyckas om

if we empower frontline health workers that are already out there

vi stärker den sjukvårdspersonal som redan finns därute

taking care of communities.

och tar hand om samhällen.

It requires a lot of training.

Det krävs mycket upplärning.

Pardis and I are very much aware of that.

Det är jag och Pardis väl medvetna om.

We've spent the past 10 years

Vi har tillbringat de senaste tio åren

training hundreds of young African scientists and clinicians.

med att träna hundratals unga afrikanska forskare och kliniker.

Over the next five years, we will train an additional 1,000 health workers

Under de kommande fem åren, kommer vi att träna ytterligare 1 000 vårdarbetare

to use Sentinel detection tools

att använda Sentinels upptäcktsverktyg

and empower them to train their colleagues.

och stärka dem i att träna sina kollegor.

This way, we will improve the original health care system

På så sätt kommer vi att förbättra de sjukvårdssystem som redan finns

and integrate surveillance into medical practice.

och integrera övervakning med medicinsk praktik.

[Since presenting their Audacious plan at TED, the world has changed ...]

[Sedan de presenterade sin djärva idé hos TED har världen förändrats ...]

Briar Goldberg: So here we are. We're recording this.

Briar Goldberg: Här är vi nu. Vi spelar in detta.

It's April 7th, 2020,

Det är den sjunde april, 2020,

and obviously, we are in the throes of this crazy global pandemic

och uppenbarligen är vi i händerna på denna bisarra globala pandemi

caused by this new coronavirus.

orsakad av det nya coronaviruset.

So you two have been working together forever,

Så ni två har jobbat tillsamans jämt,

and you really came together pretty aggressively

och kom samman ganska aggressivt under ebolakrisen 2014.

with the Ebola crisis back in 2014.

What does it feel like from your perspective?

Hur känns det från ert perspektiv?

CH: Pretty much six years after the Ebola outbreak,

CH: Ganska precis sex år efter ebola-utbrottet,

we're really facing another crisis,

står vi inför en ny kris,

and we still pretty much, like, we never learned from the previous crisis.

och vi lärde oss egentligen inte mycket av den föregående krisen.

And that, really, for me, is heartbreaking.

Och det är verkligen hjärtskärande.

PS: I think that this pandemic has shown us how unprepared we are

PS: Jag tror att den här pandemin har visat hur oförberedda vi är

everywhere in the world.

över hela världen.

Christian and our partners together had diagnostics at our hospital sites

Christian och våra partners hade diagnostik på våra sjukhus

in Nigeria, Sierra Leone and Senegal in early February.

i Nigeria, Sierra Leone och Senegal tidigt i februari.

Most states in the United States didn't have it until far later.

De flesta staterna i USA hade inte det förrän mycket senare.

It tells us that we are all in this together,

Det visar oss att vi är alla i detta tillsammans,

and we are all very much behind the curve.

och vi ligger alla långt bakom kurvan.

BG: So, this Sentinel system is amazing,

BG: Sentinel-systemet är häpnadsväckande,

but I know that the question that's on everybody's mind is:

men jag vet att frågan på allas läppar är: Hur spelar det in här och nu?

How is that playing into the here and now?

PS: You know, we describe Sentinel as a pandemic preemption system,

PS: Vi beskriver Sentinel som ett förekommande system för pandemier

och här är vi i en pandemi.

and here we are in a pandemic.

But what's great is that, actually, the same tools you need

Men vad som är jättebra är att de verktyg som krävs

to preempt a pandemic

för att förekomma pandemier är samma som krävs för att svara på en.

are the ones that you need to respond to one.

And so all of the technologies that we have laid out --

Och på så sätt är alla teknologier som vi har lagt fram -

the point-of-care testing, the multiplex testing,

patientnära tester, multiplextester,

the discovery and tracking of the virus as it's changing,

upptäckten och spårandet av viruset medan det utvecklas,

and the overlay of the mobile applications to dashboard --

och överläggandet av de mobila applikationerna till instrumentpanelen -

are all critical.

är alla ovärderliga.

CH: For us, it is a war.

CH: För oss är detta ett krig.

We are basically committed for 24 hours' turnaround time

Vi är i princip bundna till 24 timmars väntetid

in order to give results,

för att ge resultat

and that requires for us to work around the clock nonstop.

och det kräver att vi jobbar nonstop under dygnets alla timmar.

So it's a pretty challenging moment.

Så det är en utmanande tid. Vi är borta från våra familjer.

We are away from family.

At least I have the privilege to see family today,

Jag fick möjligheten att träffa min familj idag

and then I'm sure tomorrow I'm heading back in the trenches.

och jag är säker på att imorgon är jag tillbaka i skyttegraven.

In my lab, we sequenced the first COVID-19 genome

I mitt labb sekvensbestämde vi det första COVID-19 genomet i Afrika,

on the African continent,

and that really was done within 48 hours.

och det gjordes inom 48 timmar.

This is revolutionary coming from Africa

Det är revolutionerande att detta kommer från Afrika

and then making this information available for the global health community

och att informationen görs tillgänglig för det globala hälsosamhället

för att se hur viruset ser ut i Afrika.

to see what the virus within Africa looks like.

I believe that with technologies and knowledge

Jag tror att med teknik och kunskap

and then sharing information,

och genom att dela information, kan vi göra bättre ifrån oss och övervinna detta.

we can do better and then we can overcome.

PS: The whole idea of Sentinel

PS: Hela idén med Sentinel är att vi alla vaktar varandra.

is that we all stand guard over each other.

We all watch.

Alla övervakar. Varenda en är en vaktpost.

Each one of us is a sentinel.

Each one of us, being able to monitor what is making us sick,

Varenda en kan observera vad som gör oss sjuka,

can share that with the rest of our community.

och dela detta med resten av gemenskapen.

And I think that is what I profoundly want,

Och jag tror att vad vi verkligen vill

is for us to all stand guard

är att vi alla håller vakt och övervakar varandra.

and watch over each other.

[Dr. Pardis Sabeti and Dr. Christian Happi]

[Dr. Pardis Sabeti och Dr. Christian Happi]

[Ingenious scientists.

[Skickliga forskare.

Courageous partners.

Modiga partners.

Global heroes.]

Globala hjältar.]