A virus detection network to stop the next pandemic | Pardis Sabeti and Christian Happi

Korektor: Martin Kabát

[V Lednu 2020,

Christian Happi a Pardis Sabeti představili myšlenku v Projektu Odvahy]

[Sentinel: Systém včasného varování detekce a sledování příští pandemie]

[In January 2020,

Christian Happi and Pardis Sabeti presented an Audacious idea]

[Takto by to mělo fungovat....]

[Sentinel: An early warning system to detect and track the next pandemic]

CH: Sentinel je proaktivní systém včasného varování pro zabránění pandemie.

[Here's how it would work ...]

Je postaven na třech hlavních pilířích.

Christian Happi: Sentinel is a proactive early warning system to preempt pandemics.

Pardis Sabeti: První pilíř je Detekce.

Christian a já jsme studovali společně infekční choroby

po celém světě dvě desetiletí.

It is built on three major pillars.

Používali jsme posloupnost genomu.

Pardis Sabeti: The first pillar is Detect.

Přečtení kompletní genetické informace mikrobu

Christian and I have been studying infectious diseases together

nám umožňuje indentifikovat viry. Dokonce i ty, co jsme dříve neviděli,

around the world for two decades.

We have been using genome sequencing.

kontrolovat je jak se šíří

Reading out the complete genetic information of a microbe,

a sledovat jejich mutace.

A nyní s mocnou technologií úpravy genů CRISPR,

it allows us to identify viruses, even those we've never seen before,

můžeme použít tyto genetické informace.

track them as they spread

k rychlému sestavení citlivých diagnostických testů pro jakýkoliv mikrob.

and watch for new mutations.

And now with the powerful gene-editing technology CRISPR,

we can use this genetic information

CH: Jeden z těchto nástrojů se nazývá SHERLOCK.

to rapidly design exquisitely sensitive diagnostic tests for any microbe.

Může být použit k testování známých virů na jednoduchých papírových proužcích.

CH: One of these tools is called SHERLOCK.

Je to velmi levné,

a zdravotníci v předních liniích mohou použít SHERLOCK

It can be used to test known viruses on simple paper strips.

k detekci nejrozšířenějších nebo nejvíce ohrožujících virů

It is very inexpensive,

během hodiny.

and frontline health workers can use SHERLOCK

PS: Další nástroj je CARMEN.

to detect the most common or the most threatening viruses

Vyžaduje laboratoř, ale může otestovat stovky virů současně.

Tak může personál nemocniční laboratoře otestovat pacientovy vzorky

within an hour.

PS: The other tool is CARMEN.

na širokou škálu virů

It requires a lab, but it can test for hundreds of viruses simultaneously.

během jednoho dne.

Naším dalším pilířem je Připojení.

So hospital lab staff can test patient samples

Připojit každého a sdílet tuto informaci

for a broad range of viruses

napříč komunitou veřejného zdraví.

within a day.

Our second pillar is Connect.

Ve většině případů propuknutí

sdílí nemocniční personál informace pomocí papíru, Excelu - když vůbec.

Connect everyone and share this information

across the public health community.

To činí vystopování propuknutí nemoci v rámci prostoru a času

In most outbreaks,

a koordinování odpovědi

hospital staff share case information through paper, Excel -- if at all.

extrémně obtížné.

Proto vyvíjíme cloudový systém a mobilní aplikace,

This makes tracking an outbreak through space and time

které spojují komunitu pracovníků ve zdravotnictví,

and coordinating a response

pracovníky klinik, veřejné zdravotnické týmy -- každého --,

extremely difficult.

So we're developing a cloud-based system and mobile applications

a umožňuje jim nahrát data,

provést analýzu, sdílet poznatky

that connect community health workers,

a koordinovat reakci a akční plán

clinicians, public health teams -- everyone --

ve reálném čase.

and allows them to upload data,

CH: Náš třetí pilíř je Posílení.

perform analysis, share insights

Systém vyhledávání propuknutí nákazy může být úspěšný pouze tehdy,

and coordinate a response and action plan

in real time.

pokud posílíme zdravotníky v předních liniích, kteří už jsou tam venku

CH: Our third pillar is Empower.

a pečují o komunity.

An outbreak surveillance system can only succeed

To vyžaduje mnoho školení.

Pardis a já jsme si toho velmi vědomi.

if we empower frontline health workers that are already out there

Strávili jsme posledních 10 let

školením stovek mladých afrických studentů a pracovníků klinik.

taking care of communities.

It requires a lot of training.

Během následujících pěti let budeme školit dalších 1000 zdravotníků

Pardis and I are very much aware of that.

We've spent the past 10 years

training hundreds of young African scientists and clinicians.

v používání nástrojů detekce Sentinel

a umožnit jim školit svoje kolegy.

Over the next five years, we will train an additional 1,000 health workers

Tímto způsobem můžeme zlepšit původní zdravotnický systém

to use Sentinel detection tools

a integrovat dohled do zdravotní praxe.

and empower them to train their colleagues.

This way, we will improve the original health care system

[Od chvíle, kdy představili svůj smělý plán na TED, se svět změnil...]

and integrate surveillance into medical practice.

Briar Goldberg: Tak jsme tady. Tohle natáčíme.

Je 7. dubna 2020

[Since presenting their Audacious plan at TED, the world has changed ...]

a očividně jsme uprostřed zápasu s touhle šílenou globální pandemií

Briar Goldberg: So here we are. We're recording this.

způsobenou tímto novým koronavirem.

It's April 7th, 2020,

Vy dva jste spolu pracovali věčnost

and obviously, we are in the throes of this crazy global pandemic

a skutečně jste se spojili dosti agresivně

během krize Eboly v roce 2014.

caused by this new coronavirus.

So you two have been working together forever,

Jak se cítíte z vašeho úhlu pohledu?

and you really came together pretty aggressively

CH: Víceméně šest let po propuknutí Eboly

with the Ebola crisis back in 2014.

čelíme další krizi

a stále se cítíme, že jsme se nikdy nepoučili z předchozích krizí.

What does it feel like from your perspective?

CH: Pretty much six years after the Ebola outbreak,

we're really facing another crisis,

A to je, pro mě, skutečně srdcervoucí.

PS: Myslím si, že pandemie ukázala, jak nepřipravení jsme

and we still pretty much, like, we never learned from the previous crisis.

And that, really, for me, is heartbreaking.

všude na světě.

Christian a jeho partneři měli diagnostiku v našich nemocnicích

PS: I think that this pandemic has shown us how unprepared we are

v Nigérii, Sierra Leone a Senegalu na začátku února.

everywhere in the world.

Většina států ve Spojených Státech je měla až mnohem později.

Christian and our partners together had diagnostics at our hospital sites

in Nigeria, Sierra Leone and Senegal in early February.

To nám říká, že jsme v tom stále spolu

Most states in the United States didn't have it until far later.

a jsme stále pozadu.

BG: Systém Sentinel je úžasný,

It tells us that we are all in this together,

ale vím, že otázka, na kterou každý myslí, je:

and we are all very much behind the curve.

Jak nám to pomáhá tady a teď?

BG: So, this Sentinel system is amazing,

PS: Víte, popsali jsme Sentinel jako pandemický preventivní systém

but I know that the question that's on everybody's mind is:

a teď jsme v pandemii.

Ale co je skvělé je, že skutečně nástroje, které potřebujete

How is that playing into the here and now?

k předejití pandemie

PS: You know, we describe Sentinel as a pandemic preemption system,

jsou totožné s těmi, které potřebujete jako reakci na ni.

Proto veškeré technologie, které jsme představili --

and here we are in a pandemic.

But what's great is that, actually, the same tools you need

testování v místě péče, mnohačetné testování,

to preempt a pandemic

objevení a trasování viru a jeho změn

are the ones that you need to respond to one.

And so all of the technologies that we have laid out --

a překryv mobilních aplikací na plochu --

the point-of-care testing, the multiplex testing,

jsou všechny kritické

CH: Pro nás je to válka.

the discovery and tracking of the virus as it's changing,

Jsme v podstatě odhodláni dělat 24 hodin denně,

and the overlay of the mobile applications to dashboard --

abychom dodali výsledky

are all critical.

a to pro nás znamená pracovat nepřetržitě.

CH: For us, it is a war.

We are basically committed for 24 hours' turnaround time

Je to dosti náročný okamžik.

in order to give results,

Nejsme u rodiny.

Já mám alespoň to privilegium, že vidím rodinu každý den

and that requires for us to work around the clock nonstop.

a pak jsem si jist, že zítra se vrátím zpátky do zákopů.

So it's a pretty challenging moment.

V mojí laboratoři jsme určili sekvenci prvního genomu COVID-19

We are away from family.

At least I have the privilege to see family today,

na africkém kontinentě

a toho byl dosaženo během 48 hodin.

and then I'm sure tomorrow I'm heading back in the trenches.

Je revoluční, když se toto děje v Africe

In my lab, we sequenced the first COVID-19 genome

a pak se tyto informace zpřístupní globální zdravotnické komunitě,

on the African continent,

and that really was done within 48 hours.

jak vypadá virus v Africe.

This is revolutionary coming from Africa

Věřím, že se s technologiemi a znalostmi

and then making this information available for the global health community

a pak pomocí sdílení informací

můžeme zlepšit a pak to překonat.

to see what the virus within Africa looks like.

PS: Celá myšlenka Sentinelu

I believe that with technologies and knowledge

je, že se budeme všichni bránit navzájem.

and then sharing information,

Všichni se díváme.

Každý z nás je ochránce.

we can do better and then we can overcome.

Každý z nás je schopný monitorovat, co nás činí nemocnými

PS: The whole idea of Sentinel

is that we all stand guard over each other.

a může to sdílet se zbytkem komunity.

We all watch.

Each one of us is a sentinel.

A myslím si, že to je to, co vážně chci,

Each one of us, being able to monitor what is making us sick,

abychom všichni stáli na stráži

a chránili se navzájem.

can share that with the rest of our community.

[Dr. Pardis Sabeti a Dr. Christian Happi]

And I think that is what I profoundly want,

is for us to all stand guard

[Důvtipní vědci.

Odvážní partneři.

and watch over each other.

Globální hrdinové.]

[Dr. Pardis Sabeti and Dr. Christian Happi]

[Ingenious scientists.

Courageous partners.

Global heroes.]