Rob Knight: How our microbes make us who we are

Traducteur: Julia Mirecka Relecteur: Hồng Khánh Lê

We humans have always been very concerned about the health of our bodies,

Depuis toujours, nous, les humains, nous nous préoccupons de notre santé,

but we haven't always been that good at figuring out what's important.

mais, avant, nous n'étions pas capables de déterminer ce qui est important.

Take the ancient Egyptians, for example:

Prenons l'exemple des anciens Égyptiens :

very concerned about the body parts they thought they'd need in the afterlife,

très soucieux de leurs corps,

ils étaient sûrs qu'ils en auraient besoin après la mort,

but they left some parts out.

mais ils en enlevaient certaines parties.

This part, for example.

Cette partie, par exemple.

Although they very carefully preserved the stomach, the lungs,

Même s'ils préservaient soigneusement l'estomac, les poumons,

the liver, and so forth,

le foie etc.,

they just mushed up the brain, drained it out through the nose,

ils broyaient le cerveau, le retiraient par les narines

and threw it away,

et le jetaient,

which makes sense, really,

ce qui semble logique,

because what does a brain do for us anyway?

pourquoi aurait-on besoin du cerveau ?

But imagine if there were a kind of neglected organ in our bodies

Mais imaginez, par exemple, un organe négligé dans notre corps

that weighed just as much as the brain

qui pèserait autant que le cerveau

and in some ways was just as important to who we are,

et qui serait en quelque sorte très important pour nous,

but we knew so little about and treated with such disregard.

mais on en saurait si peu qu'on le traiterait avec un tel mépris.

And imagine if, through new scientific advances,

Et imaginez qu'à travers les progrès de la science

we were just beginning to understand

nous commencions à comprendre

its importance to how we think of ourselves.

son importance pour la perception de nous-mêmes.

Wouldn't you want to know more about it?

Voudriez-vous en savoir plus ?

Well, it turns out that we do have something just like that:

Il s'avère que nous avons un tel organe :

our gut,

nos intestins,

or rather, its microbes.

ou plutôt, leurs microbes.

But it's not just the microbes in our gut that are important.

Ce ne sont pas seulement ces microbes qui sont importants.

Microbes all over our body

Les microbes dans tout le corps

turn out to be really critical to a whole range of differences

s'avèrent cruciaux pour tout un éventail de différences

that make different people who we are.

qui font que nous sommes différents.

So for example, have you ever noticed

Par exemple, avez-vous déjà remarqué

how some people get bitten by mosquitos way more often than others?

que certaines personnes sont piquées plus souvent par les moustiques ?

It turns out that everyone's anecdotal experience out camping is actually true.

Il s'avère que chacune de ces expériences a ses raisons.

For example, I seldom get bitten by mosquitos,

Par exemple, les moustiques me piquent rarement,

but my partner Amanda attracts them in droves,

alors que ma compagne en attire une multitude.

and the reason why is that we have different microbes on our skin

Ce phénomène s'explique par les microbes sur notre peau,

that produce different chemicals that the mosquitos detect.

produisant des substances chimiques, qui sont détectées par les moustiques.

Now, microbes are also really important in the field of medicine.

Aujourd'hui, les microbes sont importants dans le domaine de la médecine.

So, for example, what microbes you have in your gut

Par exemple, les microbes dans nos intestins peuvent

determine whether particular painkillers are toxic to your liver.

déterminer si un antidouleur particulier est toxique ou non pour notre foie.

They also determine whether or not other drugs will work for your heart condition.

Ils détermineront comment votre cœur réagira aux autres médicaments.

And, if you're a fruit fly, at least,

Et, si vous êtes une mouche des fruits,

your microbes determine who you want to have sex with.

vos microbes détermineront avec qui vous voulez faire l'amour.

We haven't demonstrated this in humans yet

Nous ne l'avons pas testé sur les humains

but maybe it's just a matter of time before we find out. (Laughter)

mais ce n'est qu'une question de temps avant qu'on ne le découvre. (Rires)

So microbes are performing a huge range of functions.

Les microbes remplissent donc une variété de fonctions.

They help us digest our food.

Ils nous aident à digérer,

They help educate our immune system.

à éduquer notre système immunitaire,

They help us resist disease,

à résister aux maladies

and they may even be affecting our behavior.

et ils peuvent même influencer notre comportement.

So what would a map of all these microbial communities look like?

Quelle sera la disposition de toutes ces communautés microbiennes ?

Well, it wouldn't look exactly like this,

Elle ne ressemble pas exactement à cela,

but it's a helpful guide for understanding biodiversity.

mais cela peut être utile pour comprendre la biodiversité.

Different parts of the world have different landscapes of organisms

Dans les différentes régions du monde on retrouve différents organismes

that are immediately characteristic of one place or another

qui se distinguent automatiquement d'une région à l'autre

or another.

ou encore à une autre.

With microbiology, it's kind of the same, although I've got to be honest with you:

C'est pareil avec la microbiologie, mais je tiens à vous dire :

All the microbes essentially look the same under a microscope.

tous les microbes se ressemblent sous le microscope.

So instead of trying to identify them visually,

Au lieu d'essayer de les identifier visuellement,

what we do is we look at their DNA sequences,

nous observons leur séquençage de l'ADN,

and in a project called the Human Microbiome Project,

et dans le cadre du projet Human Microbiome Project,

NIH funded this $173 million project

les NIH ont financé ce projet coûtant 173 millions de dollars,

where hundreds of researchers came together

où des centaines de chercheurs ont décidé

to map out all the A's, T's, G's, and C's,

de cartographier ces séquençages,

and all of these microbes in the human body.

ainsi que les microbes dans le corps humain.

So when we take them together, they look like this.

Si nous les mettons ensemble, ils ressemblent à ce schéma.

It's a bit more difficult to tell who lives where now, isn't it?

Il est un peu plus difficile de déterminer d'où ils proviennent, n'est-ce pas ?

What my lab does is develop computational techniques that allow us

Mon labo travaille sur les techniques informatiques qui permettraient

to take all these terabytes of sequence data

de rassembler ces téraoctets de données séquentielles

and turn them into something that's a bit more useful as a map,

pour les présenter plus efficacement sous la forme d'une carte.

and so when we do that with the human microbiome data

Ainsi, on pourrait présenter le microbiome humain

from 250 healthy volunteers,

de 250 volontaires en bonne santé

it looks like this.

sous la forme d'un tel schéma.

Each point here represents all the complex microbes

Ici, chacun des points représente tous les microbes

in an entire microbial community.

d'une communauté microbienne tout entière.

See, I told you they basically all look the same.

Je vous ai dit qu'ils se ressemblent tous.

So what we're looking at is each point represents one microbial community

On voit que chacun des points représente une communauté microbienne

from one body site of one healthy volunteer.

provenant de l'organisme en bonne santé.

And so you can see that there's different parts of the map in different colors,

Vous voyez que les différentes parties sont de couleurs différentes,

almost like separate continents.

comme des continents séparés.

And what it turns out to be

Et il s'avère

is that those, as the different regions of the body,

que les différentes parties du corps

have very different microbes in them.

contiennent des microbes très différents.

So what we have is we have the oral community up there in green.

Nous voyons la communauté microbienne buccale en vert.

Over on the other side, we have the skin community in blue,

De l'autre côté, nous avons la communauté cutanée en bleu,

the vaginal community in purple,

la communauté vaginale en violet,

and then right down at the bottom, we have the fecal community in brown.

et en bas, nous avons la communauté fécale en marron.

And we've just over the last few years

Au cours des dernières années,

found out that the microbes in different parts of the body

nous avons découvert que les microbes de notre corps

are amazingly different from one another.

se distinguent les uns des autres.

So if I look at just one person's microbes

Si on observe les microbes d'une personne,

in the mouth and in the gut,

dans la bouche et dans les intestins,

it turns out that the difference between those two microbial communities

il s'avère que la différence entre ces deux communautés microbiennes

is enormous.

est énorme.

It's bigger than the difference between the microbes in this reef

Cette différence est plus grande qu'entre les microbes de ce récif

and the microbes in this prairie.

et les microbes de cette prairie.

So this is incredible when you think about it.

C'est incroyable lorsqu'on y réfléchit.

What it means is that a few feet of difference in the human body

Cela veut dire que quelques centimètres dans le corps humain

makes more of a difference to your microbial ecology

sont plus significatives pour notre écologie microbienne

than hundreds of miles on Earth.

que des centaines de kilomètres sur Terre.

And this is not to say that two people look basically the same

Ça ne veut pas dire que deux personnes qui se ressemblent

in the same body habitat, either.

sont identiques.

So you probably heard

Vous avez probablement entendu

that we're pretty much all the same in terms of our human DNA.

que nous sommes tous pareils selon notre ADN humain.

You're 99.99 percent identical in terms of your human DNA

Vous êtes identique à 99,99 % selon votre ADN humain

to the person sitting next to you.

à la personne assise à côté de vous.

But that's not true of your gut microbes:

Ça ne concerne pas vos microbes :

you might only share 10 percent similarity

vous êtes identique à 10 % seulement

with the person sitting next to you in terms of your gut microbes.

à la personne assise à côté de vous selon les microbes dans vos intestins.

So that's as different as the bacteria on this prairie

C'est la différence qu'entre les bactéries de cette prairie

and the bacteria in this forest.

et les bactéries de cette forêt.

So these different microbes

Ces différents microbes

have all these different kinds of functions that I told you about,

remplissent différentes fonctions dont je vous ai parlé,

everything from digesting food

allant de la digestion

to involvement in different kinds of diseases,

à l'impact sur des maladies, jusqu'à

metabolizing drugs, and so forth.

la métabolisation des médicaments, etc.

So how do they do all this stuff?

Comment le font-ils ?

Well, in part it's because

D'une part, bien qu'il y ait

although there's just three pounds of those microbes in our gut,

juste 1,5 kg de microbes dans nos intestins,

they really outnumber us.

ils sont vraiment nombreux.

And so how much do they outnumber us?

Combien y en a t-il ?

Well, it depends on what you think of as our bodies.

Ça dépend de comment nous voyons notre corps.

Is it our cells?

Ce sont nos cellules ?

Well, each of us consists of about 10 trillion human cells,

Les cellules dans le corps humain sont estimées à environ 10 trillions,

but we harbor as many as 100 trillion microbial cells.

et le nombre de cellules microbiennes à 100 trillions.

So they outnumber us 10 to one.

Ils sont donc 10 fois plus nombreux que nous.

Now, you might think, well, we're human because of our DNA,

On pourrait penser qu'on est humain grâce à notre ADN,

but it turns out that each of us has about 20,000 human genes,

mais il s'avère que chacun possède environ 20 000 gènes humains,

depending on what you count exactly,

selon le type de calcul,

but as many as two million to 20 million microbial genes.

mais également 2 à 20 millions de gènes microbiens.

So whichever way we look at it, we're vastly outnumbered

Voilà, les microbes chez une personne sont largement

by our microbial symbionts.

plus nombreux et plus variées que ses celles.

And it turns out that in addition to traces of our human DNA,

Et il s'avère d'ailleurs qu'à part des traces d'ADN humain,

we also leave traces of our microbial DNA

nous laissons des traces de notre ADN microbien

on everything we touch.

sur tout ce que nous touchons.

We showed in a study a few years ago

Dans une étude, nous avons démontré

that you can actually match the palm of someone's hand up

qu'on peut retrouver la paume de main d'une personne

to the computer mouse that they use routinely

qui utilise une souris de façon systématique

with up to 95 percent accuracy.

avec une précision de 95 %.

So this came out in a scientific journal a few years ago,

Cette étude a été publiée dans une revue scientifique,

but more importantly, it was featured on "CSI: Miami,"

et elle est apparue dans « Les experts : Miami »,

so you really know it's true.

donc vous devez y croire.

(Laughter)

(Rires)

So where do our microbes come from in the first place?

Donc, tout d'abord, d'où viennent ces microbes ?

Well if, as I do, you have dogs or kids,

Si, comme moi, vous avez des chiens ou des enfants

you probably have some dark suspicions about that,

vous avez probablement des soupçons,

all of which are true, by the way.

qui sont tous vrais.

So just like we can match you to your computer equipment

Comme on peut identifier votre équipement bureautique

by the microbes you share,

par les microbes que vous partagez,

we can also match you up to your dog.

on peut le faire avec votre chien.

But it turns out that in adults,

Mais il s'avère que chez les adultes

microbial communities are relatively stable,

les microbes sont relativement stables,

so even if you live together with someone,

donc même si on vit avec quelqu'un,

you'll maintain your separate microbial identity

on garde notre propre identité microbienne

over a period of weeks, months, even years.

pendant des semaines, des mois, et même des années.

It turns out that our first microbial communities

Il s'avère que nos premières communautés microbiennes

depend a lot on how we're born.

dépendent de la façon dont nous naissons.

So babies that come out the regular way,

Les microbes des enfants nés naturellement

all of their microbes are basically like the vaginal community,

reflètent une communauté vaginale, alors que les microbes

whereas babies that are delivered by C-section,

des enfants nés par césarienne

all of their microbes instead look like skin.

s'identifient avec la communauté cutanée.

And this might be associated with some of the differences

On pourrait l'associer aux différences de l'état de santé

in health associated with Cesarean birth,

après la naissance par césarienne,

such as more asthma, more allergies, even more obesity,

comme l'asthme, les allergies, l'obésité :

all of which have been linked to microbes now,

maladies que l'on lie maintenant aux microbes.

and when you think about it, until recently, every surviving mammal

Si on y réfléchit, jusque-là, chaque mammifère

had been delivered by the birth canal,

passe à travers le canal de naissance,

and so the lack of those protective microbes

et l'absence des microbes protecteurs,

that we've co-evolved with might be really important

qui participent dans l'évolution, peut être cruciale

for a lot of these different conditions that we now know involve the microbiome.

pour une variété de facteurs dépendant du microbiome.

When my own daughter was born a couple of years ago

Lorsque ma fille est née par césarienne

by emergency C-section,

il y a quelques années,

we took matters into our own hands

nous avons pris les choses en main

and made sure she was coated with those vaginal microbes

pour lui assurer un contact avec la flore du vagin

that she would have gotten naturally.

dont elle était privée.

Now, it's really difficult to tell whether this has had an effect

Maintenant, il est difficile de dire si cela a eu un impact particulier

on her health specifically, right?

sur son état de santé ou non.

With a sample size of just one child, no matter how much we love her,

En prenant en compte un seul enfant, indépendamment de notre amour,

you don't really have enough of a sample size

nous n'avons pas assez de preuves

to figure out what happens on average,

pour dire ce qui se produit en moyenne,

but at two years old, she hasn't had an ear infection yet,

mais à l'âge de 2 ans, elle n'a pas encore eu d'otite,

so we're keeping our fingers crossed on that one.

donc nous croisons les doigts pour elle.

And what's more, we're starting to do clinical trials with more children

De plus, nous avons commencé à mener des essais cliniques

to figure out whether this has a protective effect generally.

sur les enfants pour tester l'efficacité de cette protection.

So how we're born has a tremendous effect on what microbes we have initially,

La façon dont nous venons au monde a un impact immense sur nos microbes,

but where do we go after that?

mais que peut-on faire avec ce savoir ?

What I'm showing you again here is this map

Ce que je vous montre, c'est à nouveau le schéma

of the Human Microbiome Project Data,

dont je vous ai parlé,

so each point represents a sample from one body site

où chacun des points représente une des parties du corps

from one of 250 healthy adults.

d'un adulte en bonne santé parmi 250.

And you've seen children develop physically.

Vous avez observé le développement physique

You've seen them develop mentally.

et cognitif des enfants.

Now, for the first time, you're going to see

Pour la première fois, nous allons découvrir

one of my colleague's children develop microbially.

le développement microbien d'un enfant de mon collègue.

So what we are going to look at

On observera ses selles,

is we're going to look at this one baby's stool,

et notamment

the fecal community, which represents the gut,

la communauté fécale représentée par les intestins,

sampled every week for almost two and a half years.

récupérées chaque semaine durant presque 2 ans et demi.

And so we're starting on day one.

Le premier jour de l'enfant.

What's going to happen is that the infant is going to start off as this yellow dot,

Il commence comme ce point jaune,

and you can see that he's starting off basically in the vaginal community,

et vous voyez que cela se produit dans la communauté vaginale, ce qui est

as we would expect from his delivery mode.

prévu pour la naissance naturelle.

And what's going to happen over these two and a half years

Et durant ces 2 années et demie,

is that he's going to travel all the way down

il passera vers le bas pour atteindre

to resemble the adult fecal community from healthy volunteers down at the bottom.

la communauté fécale d'un adulte en bonne santé en bas.

So I'm just going to start this going and we'll see how that happens.

Regardons de plus près ce qui va se passer.

What you can see, and remember each step in this is just one week,

Souvenez-vous que chaque étape se déroule en juste une semaine.

what you can see is that week to week,

Vous voyez que chaque semaine

the change in the microbial community of the feces of this one child,

les différences observées pour les microbes des selles de cet enfant

the differences week to week are much greater

sont beaucoup plus grandes

than the differences between individual healthy adults

que les différences entre des adultes en bonne santé

in the Human Microbiome Project cohort,

participants à notre projet

which are those brown dots down at the bottom.

et représentés par ces points marron en bas.

And you can see he's starting to approach the adult fecal community.

Et vous voyez qu’il se rapproche de la communauté fécale de l’adulte

This is up to about two years.

jusqu’à ses deux ans.

But something amazing is about to happen here.

Mais il se passe quelque chose d’incroyable.

So he's getting antibiotics for an ear infection.

Il reçoit des antibiotiques pour soigner une otite.

What you can see is this huge change in the community,

Vous voyez un changement important dans la communauté,

followed by a relatively rapid recovery.

suivi d’une récupération assez rapide.

I'll just rewind that for you.

Je reviens en arrière pour vous.

And what we can see is that just over these few weeks,

Vous voyez que, durant ces quelques semaines,

we have a much more radical change,

nous avons un changement radical,

a setback of many months of normal development,

un retard de quelques mois sur un développement normal

followed by a relatively rapid recovery,

suivi d’une récupération assez rapide.

and by the time he reaches day 838,

Avant qu’il atteigne 838 jours,

which is the end of this video,

ce qu’on verra à la fin de la vidéo,

you can see that he has essentially reached the healthy adult stool community,

vous voyez qu’il présente une communauté fécale

despite that antibiotic intervention.

d'un adulte sain malgré la prise d’antibiotiques.

So this is really interesting because it raises fundamental questions

C’est très intéressant car cela soulève des questions importantes

about what happens when we intervene at different ages in a child's life.

sur l’effet d’une intervention à différents âges de l’enfant.

So does what we do early on, where the microbiome is changing so rapidly,

Une intervention est-elle si importante lorsque le changement du microbiome

actually matter,

est aussi dynamique ?

or is it like throwing a stone into a stormy sea,

Ou est-ce comme lancer un caillou dans une mer agitée

where the ripples will just be lost?

où les ricochets vont disparaître ?

Well, fascinatingly, it turns out that if you give children antibiotics

Il est fascinant de découvrir que si on leur donne des antibiotiques

in the first six months of life,

au cours des six premiers mois,

they're more likely to become obese later on

ils risquent davantage de devenir obèses à l'âge adulte.

than if they don't get antibiotics then or only get them later,

Le risque est moindre s’ils les reçoivent plus tardivement.

and so what we do early on may have profound impacts

Ce que nous faisons au début peut avoir un impact important sur

on the gut microbial community and on later health

la communauté microbienne des intestins et sur notre santé à l’âge adulte,

that we're only beginning to understand.

ce que nous commençons à comprendre.

So this is fascinating, because one day, in addition to the effects

Cela est fascinant, car un jour, en plus de l’effet que les antibiotiques

that antibiotics have on antibiotic-resistant bacteria,

ont sur les bactéries résistantes,

which are very important,

qui restent très importantes,

they may also be degrading our gut microbial ecosystems,

ils peuvent également dégrader notre flore intestinale.

and so one day we may come to regard antibiotics with the same horror

Un jour, on commencera à voir les antibiotiques de la même manière

that we currently reserve for those metal tools

que l’on perçoit aujourd’hui les outils en métal,

that the Egyptians used to use to mush up the brains

que les Égyptiens utilisaient pour le cerveau

before they drained them out for embalming.

avant de le retirer lors de l’embaumement.

So I mentioned that microbes have all these important functions,

J'ai dit que les microbes remplissent des fonctions importantes

and they've also now, just over the past few years,

et on sait depuis quelques années,

been connected to a whole range of different diseases,

qu’ils ont un lien avec une grande variété de maladies,

including inflammatory bowel disease,

dont la maladie intestinale inflammatoire,

heart disease, colon cancer,

les maladies cardiaques,

and even obesity.

le cancer du côlon, et même l’obésité.

Obesity has a really large effect, as it turns out,

Il s’avère que l’obésité est un problème d’envergure

and today, we can tell whether you're lean or obese

et aujourd'hui, on peut dire si vous êtes obèse

with 90 percent accuracy

avec une précision de 90 %

by looking at the microbes in your gut.

en examinant les microbes des intestins.

Now, although that might sound impressive,

Même si cela semble impressionnant,

in some ways it's a little bit problematic as a medical test,

il serait difficile d’effectuer un tel examen médical,

because you can probably tell which of these people is obese

car on est capable de dire laquelle de ces personnes est obèse,

without knowing anything about their gut microbes,

sans analyser les microbes présents dans ses intestins.

but it turns out that even if we sequence their complete genomes

Il s’avère que même si on séquençait son génome

and had all their human DNA,

et qu’on avait son ADN humain,

we could only predict which one was obese with about 60 percent accuracy.

on pourrait déterminer quelle personne est obèse avec une précision de 60 %.

So that's amazing, right?

C’est incroyable?

What it means that the three pounds of microbes that you carry around with you

Cela veut dire qu’un kilogramme de vos microbes

may be more important for some health conditions

peut être plus important pour votre santé

than every single gene in your genome.

que chacun de vos gènes.

And then in mice, we can do a lot more.

Grâce aux souris, on peut aller plus loin.

So in mice, microbes have been linked to all kinds of additional conditions,

Pour les souris, les microbes ont un lien avec différents types de maladies,

including things like multiple sclerosis,

dont la sclérose en plaques,

depression, autism, and again, obesity.

la dépression, l’autisme et l’obésité.

But how can we tell whether these microbial differences

Comment peut-on savoir si ces différences microbiennes,

that correlate with disease are cause or effect?

liées aux maladies, en sont la cause ou la conséquence ?

Well, one thing we can do is we can raise some mice

Nous pourrions par exemple élever quelques souris,

without any microbes of their own in a germ-free bubble.

en les privant des microbes dans une bulle sans germes.

Then we can add in some microbes that we think are important,

On pourrait ajouter des microbes que l’on pense importants

and see what happens.

et observer leurs effets.

When we take the microbes from an obese mouse

Si on prélève les microbes d’une souris obèse

and transplant them into a genetically normal mouse

et les transplante dans une souris en bonne santé,

that's been raised in a bubble with no microbes of its own,

élevée dans une bulle et privée de ses propres microbes,

it becomes fatter than if it got them from a regular mouse.

elle devient plus grosse que si on les prélève d’une souris saine.

Why this happens is absolutely amazing, though.

Les raisons qui l'expliquent sont fascinantes.

Sometimes what's going on is that the microbes

Parfois, les microbes

are helping them digest food more efficiently from the same diet,

les aident à digérer la nourriture de manière plus efficace,

so they're taking more energy from their food,

et exploiter l’énergie provenant des aliments.

but other times, the microbes are actually affecting their behavior.

Mais d’autres fois, les microbes influencent leur comportement.

What they're doing is they're eating more than the normal mouse,

Elles mangent plus qu’une souris normale,

so they only get fat if we let them eat as much as they want.

et grossissent si elles mangent autant qu’elles veulent.

So this is really remarkable, right?

C’est vraiment remarquable, n’est-ce pas?

The implication is that microbes can affect mammalian behavior.

Les microbes peuvent avoir un impact sur le comportement des mammifères.

So you might be wondering whether we can also do this sort of thing across species,

Vous vous demandez peut-être si on peut le réaliser entre différentes espèces.

and it turns out that if you take microbes from an obese person

Il s’avère que si on prend les microbes d’une personne obèse

and transplant them into mice you've raised germ-free,

et qu’on les transplante à celle élevée dans un espace stérile,

those mice will also become fatter

elle sera également plus grosse

than if they received the microbes from a lean person,

qu’une souris ayant reçu les microbes d’une personne mince.

but we can design a microbial community that we inoculate them with

Mais, on peut créer une communauté qu’on leur inoculerait

that prevents them from gaining this weight.

pour empêcher de prendre du poids.

We can also do this for malnutrition.

On peut faire pareil avec la malnutrition.

So in a project funded by the Gates Foundation,

Dans le cadre du projet réalisé par la Gates Foundation,

what we're looking at is children in Malawi

on examine les enfants du Malawi

who have kwashiorkor, a profound form of malnutrition,

souffrant de kwashiorkor, un extrême de malnutrition.

and mice that get the kwashiorkor community transplanted into them

Les souris qui reçoivent les microbes responsables du kwashiorkor,

lose 30 percent of their body mass

perdent 30 % de leur poids

in just three weeks,

en juste trois semaines.

but we can restore their health by using the same peanut butter-based supplement

Mais, on peut rétablir leur état de santé à l’aide du même aliment à base

that is used for the children in the clinic,

de cacahuètes comme dans les cliniques.

and the mice that receive the community

Les souris ayant reçu des microbes

from the healthy identical twins of the kwashiorkor children do fine.

d’un vrai jumeau sain, guéris de kwashiorkor, se portent bien.

This is truly amazing because it suggests that we can pilot therapies

C’est vraiment incroyable car on peut mener des thérapies

by trying them out in a whole bunch of different mice

et les tester sur une variété de souris, en utilisant

with individual people's gut communities

des communautés fécales des hommes

and perhaps tailor those therapies all the way down to the individual level.

et peut-être orienter ces thérapies jusqu’au niveau de l’individu.

So I think it's really important that everyone has a chance

Il est vraiment important que chacun puisse participer

to participate in this discovery.

à cette découverte.

So, a couple of years ago,

Il y a quelques années,

we started this project called American Gut,

nous avons lancé le projet « American Gut »

which allows you to claim a place for yourself on this microbial map.

vous permettant de retrouver votre place sur la carte microbienne.

This is now the largest crowd-funded science project that we know of --

C'est le plus grand projet scientifique au financement participatif

over 8,000 people have signed up at this point.

qu'on connaît, qui jusque-là, inclut plus de 8000 personnes.

What happens is, they send in their samples,

Ils nous envoient leurs échantillons,

we sequence the DNA of their microbes and then release the results back to them.

on séquence l’ADN de leurs microbes, et on leur envoie les résultats.

We also release them, de-identified, to scientists, to educators,

Une fois anonymisés, on les partage avec des chercheurs, des formateurs,

to interested members of the general public, and so forth,

et d’autres personnes intéressées, etc.,

so anyone can have access to the data.

donc tout le monde a accès à ces données.

On the other hand,

En revanche,

when we do tours of our lab at the BioFrontiers Institute,

lorsqu’on fait visiter notre labo au BioFrontiers Institute

and we explain that we use robots and lasers to look at poop,

et qu’on explique l'utilité des robots et des lasers pour examiner le caca,

it turns out that not everyone wants to know.

il s’avère que ce n'est pas tout le monde qui veut le savoir.

(Laughter)

(Rires)

But I'm guessing that many of you do,

Mais j’imagine que vous

and so I brought some kits here if you're interested

voulez le savoir donc j’ai ramené quelques outils,

in trying this out for yourself.

si vous souhaitez le découvrir par vous-mêmes.

So why might we want to do this?

Pourquoi est-ce utile ?

Well, it turns out that microbes are not just important

Les microbes sont non seulement importants

for finding out where we are in terms of our health,

pour connaître notre état de santé,

but they can actually cure disease.

mais ils peuvent surtout guérir des maladies.

This is one of the newest things we've been able to visualize

C’est une nouvelle découverte que nous avons pu observer

with colleagues at the University of Minnesota.

avec mes collègues de l’Université de Minnesota.

So here's that map of the human microbiome again.

Vous voyez à nouveau la carte du microbiome humain.

What we're looking at now --

Ce qu’on voit maintenant,

I'm going to add in the community of some people with C. diff.

je vais y ajouter la communauté des personnes souffrant de CPM.

So, this is a terrible form of diarrhea

Une forme de diarrhée très sévère qui pousse

where you have to go up to 20 times a day,

à aller aux toilettes jusqu’à 20 fois par jour.

and these people have failed antibiotic therapy for two years

Avant qu’elles ne soient sélectionnées, ces personnes prenaient

before they're eligible for this trial.

des antibiotiques durant 2 ans, sans aucun effet.

So what would happen if we transplanted some of the stool from a healthy donor,

Que se passerait-il si on transplantait une partie des selles d’un donneur sain,

that star down at the bottom,

que vous voyez en bas,

into these patients.

chez ces patients.

Would the good microbes do battle with the bad microbes

Les bons microbes se batteraient-ils avec les mauvais

and help to restore their health?

pour aider à rétablir leur état de santé ?

So let's watch exactly what happens there.

Regardons ce qui se passe précisément ici.

Four of those patients are about to get a transplant

Quatre de ces patients vont bénéficier d'une greffe

from that healthy donor at the bottom,

d’un donneur sain en bas.

and what you can see is that immediately,

Ce que vous pouvez observer,

you have this radical change in the gut community.

c’est ce changement radical dans les intestins.

So one day after you do that transplant,

Une journée après la transplantation,

all those symptoms clear up,

les symptômes disparaissent,

the diarrhea vanishes,

la diarrhée aussi,

and they're essentially healthy again, coming to resemble the donor's community,

ils se rétablissent, avec une communauté pareil à celle du donneur

and they stay there.

qui y reste.

(Applause)

(Applaudissements)

So we're just at the beginning of this discovery.

Nous ne sommes qu’aux débuts de cette découverte.

We're just finding out that microbes have implications

Nous savons maintenant que les microbes ont un impact

for all these different kinds of diseases,

sur toutes ces maladies différentes, comme

ranging from inflammatory bowel disease to obesity,

la maladie intestinale inflammatoire, l’obésité,

and perhaps even autism and depression.

et peut-être l’autisme et la dépression.

What we need to do, though,

Nous devons cependant

is we need to develop a kind of microbial GPS,

créer une sorte du GPS microbien

where we don't just know where we are currently

qui nous permettrait de nous localiser,

but also where we want to go and what we need to do

et aussi d’indiquer la direction et les actions nécessaires

in order to get there,

pour y arriver.

and we need to be able to make this simple enough

On doit être capable de faciliter ce processus

that even a child can use it. (Laughter)

de sorte qu’un enfant puisse l’utiliser. (Rires)

Thank you.

Merci.

(Applause)

(Applaudissements)