How do you know if you have a virus? - Cella Wright

Translator: Nela Kolčáková Reviewer: Zuzana Munzarová Dziaková

A new virus emerges and spreads like wildfire.

Objavil sa nový vírus a šíri sa rýchlosťou svetla.

In order to contain it,

Na to, aby sme ho mohli zastaviť,

researchers must first collect data about who’s been infected.

musíme najprv mať informácie o tom, kto už je nakazený.

Two main viral testing techniques are critical:

Existujú dva najdôležitejšie spôsoby testovania na vírus.

one tells you if you have the virus

Jeden vám povie, či ste nakazený,

and the other shows if you’ve already had it.

druhý zase, či už ste nakazený boli.

So, how exactly do these tests work?

Ako vlastne tieto testy fungujú?

PCR, or polymerase chain reaction testing,

Test pomocou PCR, teda polymerázovej reťazovej reakcie,

targets the virus’s genetic material in the body

je zameraný na genetický materiál vírusu, ktorý sa nachádza v tele

and is used to diagnose someone who is currently infected.

a používa sa pri diagnostike tých, ktorí sú práve nakazení.

Yet, this genetic material may be present in such imperceptible amounts

Avšak, tento genetický materiál sa môže vyskytovať v takých malých množstvách,

that actually detecting it is difficult.

ktoré sa dajú len ťažko zachytiť.

This is where PCR comes in:

A práve tu prichádza na scénu PCR.

it’s widely used to amplify genetic information to large enough quantities

Bežne sa používa na amplifikáciu genetickej informácie na také množstvo,

that it can be readily observed.

ktoré sa dá jednoducho pozorovať.

To develop a PCR test for a never-before-seen virus,

Keď chcú vedci vyvinúť PCR test pre úplne nový vírus,

researchers first sequence its genetic material, or genome,

najprv osekvenujú jeho genetický materiál či genóm

and identify regions that are unique to that specific virus.

a potom sa snažia identifikovať miesta, ktoré sú špecifické pre daný vírus.

PCR then targets these particular segments.

PCR sa zameria práve na tieto segmenty.

A PCR test begins by collecting a sample:

PCR test sa začína odobratím vzorky:

this can be blood for hepatitis viruses, feces for poliovirus,

pre vírusy heptatitídy z krvi, pre poliovírus zo stolice

and samples from the nose or throat for coronaviruses.

a pre koronavírusy z nosu alebo hrdla.

The sample is taken to a central laboratory

Vzorka sa prevezie do centrálneho laboratória,

where PCR is performed to test for the presence of the virus’ genome.

kde sa spraví PCR, aby sa zistilo, či je vo vzorke genóm vírusu.

Genetic information can be encoded via DNA or RNA.

Genetická informácia môže byť zakódovaná pomocou DNA alebo RNA.

HPV, for example, uses DNA, while SARS-CoV-2, the cause of COVID-19,

Napríklad HPV (papilomavírus) má DNA, ale SARS-CoV-2, pôvodca COVID-19,

uses RNA.

má RNA.

Before running the PCR, the viral RNA— if present—

Ešte pred PCR musí byť virálna RNA, ak tam je,

must be reverse transcribed to make a strand of complementary DNA.

reverznou transkripciou prepísaná na komplementárne vlákno DNA.

Researchers then run the PCR.

Vedci potom spravia PCR.

If the virus is present in the sample, its unique regions of genetic code

Ak je vírus vo vzorke, špecifické časti jeho genetického kódu

will be identified by complementary primers and copied by enzymes.

budú identifikované komplementárnymi primérmi a nakopírované enzýmami.

One strand of DNA becomes hundreds of millions,

Z jedného vlákna DNA sa vyrobia stovky miliónov kópií,

which are detected using probes marked with fluorescent dye.

ktoré sa potom skúmajú pomocou označenia fluorescenčnou farbou.

If the PCR machine senses fluorescence,

Ak prístroj na PCR zaznamená fluorescenciu,

the sample has tested positive for the virus,

tak má vzorka pozitívny výsledok na daný vírus,

meaning the individual is infected.

čo znamená, že testovaný jedinec je infikovaný.

Immunoassays, on the other hand,

Na druhej strane, metóda immunoassay preskúma,

tap into the immune system’s memory of the virus,

či si imunitný systém daný vírus pamätá,

showing if someone has previously been infected.

a teda, či už človek bol niekedy týmto vírusom infikovaný.

They work by targeting virus-specific antibodies generated by the immune system

Zamerajú sa na protilátky špecifické pre daný vírus,

ktoré vyrába imunitný systém počas infekcie.

during infection.

These are specialized classes of proteins

Je to špecializovaná skupina proteínov,

that identify and fight foreign substances, like viruses.

ktoré identifikujú cudzie látky, napr. vírusy, a bojujú proti nim.

Immunoassays may detect IgG antibodies, the most abundant class,

Metóda immunoassay môže zistiť prítomnosť protilátok IgG, ktoré sú najpočetnejšie,

and IgM antibodies, the type that’s first produced in response to a new infection.

a protilátok IgM, ktoré sú produkované ako odpoveď na novú infekciu.

The presence of IgM antibodies suggests a recent infection,

Prítomnosť protilátok IgM značí nedávnu nákazu,

but since it can take the body over a week to produce a detectable amount,

ale keďže telu môže trvať až vyše týždňa, kým vyrobí detegovateľné množstvo,

they’re unreliable in diagnosing current infections.

nie sú pri diagnostikovaní prebiehajúcich infekcií spoľahlivé.

Meanwhile, IgG antibodies circulate for an extended period after infection;

Na druhej strane, protilátky IgG kolujú v krvi aj dlhší čas po infekcii.

their presence usually indicates that someone was exposed and recovered.

Ich prítomnosť väčšinou znamená, že niekto bol nakazený a vyliečil sa.

Before the immunoassay,

Pred použitím metódy immunoassay

health professionals draw blood from an individual.

musia zdravotníci odobrať jedincovi krv.

This sample then comes into contact with a portion of the virus of interest.

Vzorka príde do kontaktu s časťou vírusu, ktorý nás zaujíma.

If the body has, in fact, been exposed to the virus in the past,

Ak bolo v minulosti telo naozaj vystavené vírusu,

the body’s virus-specific antibodies will bind to it during the test.

jeho protilátky špecifické pre daný vírus sa na naň počas testu naviažu.

This reaction produces a change in color, indicating that the sample tested positive

Táto reakcia spôsobí zmenu farby, čo indikuje pozitívny výsledok testu,

and that the individual has been exposed to the virus.

a teda, že jedinec už bol vírusu vystavený.

Immunoassays are especially important

Metóda immunoassay je dôležitá v prípade,

when it comes to retroactively diagnosing people

ak ide o spätné diagnostikovanie ľudí,

who were infected but went untested.

ktorí boli nakazení, ale neboli testovaní.

And there’s exciting potential for those who have developed immunity to a virus:

A tí, ktorí si vytvorili imunitu na vírus, skrývajú vzrušujúci potenciál:

in some cases, their blood plasma could be used as treatment

v niektorých prípadoch môže byť ich krvná plazma použitá ako liek

in people who are currently fighting it.

pre ľudí, ktorí práve s vírusom bojujú.

PCR and immunoassays are always in the process

PCR a immunoassay sa stávajú

of becoming more accurate and efficient.

viac a viac presnejšími a účinnejšími metódami.

For example,

Napríklad,

innovations in PCR have led to the use of self-contained testing devices

inovácie v PCR viedli k tomu, že sa začali používať autonómne testovacie prístroje,

that relay results within one hour.

ktoré prinesú výsledok do jednej hodiny.

Digital PCR, which quantifies individual pieces of target DNA,

Digitálna PCR, ktorá kvantifikuje jednotlivé kúsky cieľovej DNA,

shows promise in further boosting accuracy.

by mohla v budúcnosti ešte viac zvýšiť presnosť.

And although immunoassays are difficult to develop quickly,

A hoci je náročné metódu immunoassay rýchlo pripraviť,

researchers in Singapore were able to create one for SARS-CoV-2

vedci v Singapúre ju dokázali vyrobiť pre SARS-CoV-2

even before COVID-19 was declared a pandemic.

ešte pred tým, ako bol COVID-19 vyhlásený za pandémiu.

These tests— along with the scientists who develop them

Tieto testy – spolu s vedcami, ktorí ich vyvíjajú,

and the health professionals who administer them—

a zdravotníkmi, ktorí ich používajú –

are absolutely essential.

sú absolútne nevyhnutné.

And when deployed early, they can save millions of lives.

A keď sú nasadené dostatočne skoro, majú potenciál zachrániť milióny životov.