How do you know if you have a virus? - Cella Wright

Traducteur: Ludovica Harley Relecteur: Anne-Sophie Matichard

A new virus emerges and spreads like wildfire.

Un nouveau virus émerge et se propage comme un feu de forêt.

In order to contain it,

Afin de le contenir,

researchers must first collect data about who’s been infected.

les chercheurs doivent d’abord recueillir des données sur les personnes infectées.

Two main viral testing techniques are critical:

Deux techniques principales de dépistage sont essentielles :

one tells you if you have the virus

l'une vous dit si vous avez le virus

and the other shows if you’ve already had it.

et l'autre vous montre si vous l'avez déjà eu.

So, how exactly do these tests work?

Comment fonctionnent donc ces tests ?

PCR, or polymerase chain reaction testing,

La PCR, ou test de réaction de polymérisation en chaîne,

targets the virus’s genetic material in the body

cible le matériel génétique du virus dans le corps

and is used to diagnose someone who is currently infected.

et est utilisée pour diagnostiquer quelqu’un qui est infecté.

Yet, this genetic material may be present in such imperceptible amounts

Pourtant, ce matériel génétique peut être présent

dans des quantités si imperceptibles qu’il est difficile de le détecter.

that actually detecting it is difficult.

This is where PCR comes in:

C’est là que la PCR intervient :

it’s widely used to amplify genetic information to large enough quantities

elle est largement utilisée pour amplifier l'information génétique,

suffisamment pour qu’elle soit facilement observée.

that it can be readily observed.

To develop a PCR test for a never-before-seen virus,

Pour développer un test PCR pour un virus jamais vu auparavant,

researchers first sequence its genetic material, or genome,

les chercheurs séquencent d'abord son matériel génétique, ou génome,

and identify regions that are unique to that specific virus.

et identifient les régions qui sont uniques à ce virus spécifique.

PCR then targets these particular segments.

La PCR cible ensuite ces segments particuliers.

A PCR test begins by collecting a sample:

Un test PCR commence par le prélèvement d’un échantillon :

this can be blood for hepatitis viruses, feces for poliovirus,

ça peut être du sang pour les virus de l’hépatite,

des selles pour le poliovirus,

and samples from the nose or throat for coronaviruses.

et des échantillons du nez ou de la gorge pour les coronavirus.

The sample is taken to a central laboratory

L'échantillon est prélevé dans un laboratoire central,

where PCR is performed to test for the presence of the virus’ genome.

où le test PCR est effectué pour tester la présence du génome du virus.

Genetic information can be encoded via DNA or RNA.

L'information génétique peut être encodée par l’ADN ou l’ARN.

HPV, for example, uses DNA, while SARS-CoV-2, the cause of COVID-19,

Par exemple, le papillomavirus utilise l'ADN,

tandis que le SRAS-Cov-2, la cause du COVID-19, utilise l'ARN.

uses RNA.

Before running the PCR, the viral RNA— if present—

Avant d’effectuer le test PCR, l’ARN viral, s’il est présent,

must be reverse transcribed to make a strand of complementary DNA.

doit être transcrit à l’envers pour former un brin d’ADN complémentaire.

Researchers then run the PCR.

Les chercheurs exécutent ensuite la PCR.

If the virus is present in the sample, its unique regions of genetic code

Si le virus est présent dans l'échantillon,

ses régions uniques de matériel génétique

will be identified by complementary primers and copied by enzymes.

seront identifiées par des amorces complémentaires

et copiées par des enzymes.

One strand of DNA becomes hundreds of millions,

Un brin d’ADN devient des centaines de millions,

which are detected using probes marked with fluorescent dye.

qui sont détectés en utilisant de sondes marquées d'un pigment fluorescent.

If the PCR machine senses fluorescence,

Si la machine PCR détecte la fluorescence,

the sample has tested positive for the virus,

l’échantillon est positif pour le virus,

meaning the individual is infected.

ce qui signifie que la personne est infectée.

Immunoassays, on the other hand,

D'autre part, les tests immunologiques

tap into the immune system’s memory of the virus,

puisent dans la mémoire du système immunitaire du virus,

showing if someone has previously been infected.

montrant si une personne a déjà été infectée.

They work by targeting virus-specific antibodies generated by the immune system

Ils agissent en ciblant les anticorps spécifiques au virus

générés par le système immunitaire pendant l'infection.

during infection.

These are specialized classes of proteins

Ce sont des classes spécialisées de protéines qui identifient

that identify and fight foreign substances, like viruses.

et combattent les substances étrangères, comme les virus.

Immunoassays may detect IgG antibodies, the most abundant class,

Les tests immunologiques peuvent détecter les anticorps IgG,

la classe la plus abondante,

and IgM antibodies, the type that’s first produced in response to a new infection.

et les anticorps IgM,

le premier type produit en réponse à une nouvelle infection.

The presence of IgM antibodies suggests a recent infection,

La présence d’anticorps IgM suggère une infection récente,

but since it can take the body over a week to produce a detectable amount,

mais comme le corps peut mettre plus d’une semaine

à produire une quantité détectable,

they’re unreliable in diagnosing current infections.

ils ne sont pas fiables pour diagnostiquer les infections actuelles.

Meanwhile, IgG antibodies circulate for an extended period after infection;

Entre-temps, les anticorps IgG circulent pendant longtemps après l’infection ;

their presence usually indicates that someone was exposed and recovered.

ils indiquent habituellement qu'une personne a été infectée et est guérie.

Before the immunoassay,

Avant les tests immunologiques,

health professionals draw blood from an individual.

les professionnels de la santé prélevaient du sang d’une personne.

This sample then comes into contact with a portion of the virus of interest.

Cet échantillon entre en contact avec une partie du virus concerné.

If the body has, in fact, been exposed to the virus in the past,

Si le corps a en effet été exposé au virus dans le passé,

the body’s virus-specific antibodies will bind to it during the test.

les anticorps spécifiques au virus vont se lier à celui-ci pendant le test.

This reaction produces a change in color, indicating that the sample tested positive

Cette réaction produit un changement de couleur

indiquant que l’échantillon est positif et que cette personne a été exposée au virus.

and that the individual has been exposed to the virus.

Immunoassays are especially important

Les tests immunologiques sont importants

when it comes to retroactively diagnosing people

en ce qui concerne le diagnostic rétroactif

who were infected but went untested.

de personnes infectées mais non testées.

And there’s exciting potential for those who have developed immunity to a virus:

Et il y a un potentiel excitant pour ceux qui ont développé l’immunité à un virus :

in some cases, their blood plasma could be used as treatment

dans certains cas, leur plasma sanguin pourrait être utilisé comme traitement

in people who are currently fighting it.

pour les gens qui le combattent actuellement.

PCR and immunoassays are always in the process

La PCR et les tests immunologiques sont toujours développés

of becoming more accurate and efficient.

pour devenir plus précis et plus efficaces.

For example,

Par exemple,

innovations in PCR have led to the use of self-contained testing devices

les innovations en PCR ont conduit à l’utilisation

de dispositifs de tests autonomes qui donnent des résultats dans l’heure.

that relay results within one hour.

Digital PCR, which quantifies individual pieces of target DNA,

La PCR numérique, qui quantifie des morceaux individuels d’ADN cible,

shows promise in further boosting accuracy.

promet une précision accrue.

And although immunoassays are difficult to develop quickly,

Et bien que les tests immunologiques soient difficiles à développer rapidement,

researchers in Singapore were able to create one for SARS-CoV-2

les chercheurs à Singapour ont réussi à en créer un pour le SRAS-CoV-2

even before COVID-19 was declared a pandemic.

avant même que le COVID-19 ne soit qualifié de pandémie.

These tests— along with the scientists who develop them

Ces tests, avec les scientifiques qui les développent

and the health professionals who administer them—

et les professionnels de la santé qui les administrent,

are absolutely essential.

sont absolument essentiels.

And when deployed early, they can save millions of lives.

Et lorsqu’ils sont déployés tôt, ils peuvent sauver des millions de vies.