Stephen Friend: The hunt for "unexpected genetic heroes"

Translator: Zane Mitrevica Reviewer: Ilze Garda

Approximately 30 years ago,

Pirms aptuveni 30 gadiem,

when I was in oncology at the Children's Hospital

kad es strādāju Filadelfijas Bērnu slimnīcas onkoloģijas nodaļā,

in Philadelphia,

a father and a son walked into my office

manā kabinetā ienāca tēvs un dēls,

and they both had their right eye missing,

un viņiem abiem nebija labās acs.

and as I took the history, it became apparent

Izpētot slimības vēsturi, kļuva skaidrs,

that the father and the son had a rare form

ka gan tēvam, gan dēlam bija

of inherited eye tumor, retinoblastoma,

iedzimta reta acs audzēja forma — retinoblastoma,

and the father knew that he had passed that fate

un tēvs zināja,

ka viņš bija nodevis to tālāk savam dēlam.

on to his son.

That moment changed my life.

Šis mirklis mainīja manu dzīvi.

It propelled me to go on

Tas pamudināja mani turpināt darbu

and to co-lead a team that discovered

un uzņemties līdzvadīt komandu, kas atklāja

the first cancer susceptibility gene,

pirmo vēža uzņēmīgo gēnu.

and in the intervening decades since then,

Turpmākajās desmitgadēs

there has been literally a seismic shift

notika burtiski seismiska mēroga pārmaiņas

in our understanding of what goes on,

mūsu izpratnē par šūnās notiekošo

what genetic variations are sitting behind

un ģenētiskajām variācijām,

kas slēpjas aiz dažādām slimībām.

various diseases.

In fact, for thousands of human traits,

Patiesībā tūkstošiem cilvēka pazīmju

a molecular basis that's known for that,

tiek skaidrotas molekulārā līmenī,

and for thousands of people, every day,

un katru dienu tūkstošiem cilvēku

there's information that they gain

uzzina par risku

about the risk of going on to get this disease

iegūt tādu vai citādu slimību.

or that disease.

At the same time, if you ask,

Tajā pašā laikā, ja vaicājam,

"Has that impacted the efficiency,

vai tas ir ietekmējis

how we've been able to develop drugs?"

jaunu zāļu radīšanas efektivitāti,

the answer is not really.

tad atbilde ir — ne gluži.

If you look at the cost of developing drugs,

Ja aplūkojam zāļu radīšanu un tās izmaksas,

how that's done, it basically hasn't budged that.

būtībā nekas nav mainījies.

And so it's as if we have the power to diagnose

Mēs it kā spētu slimību diagnosticēt,

yet not the power to fully treat.

taču nespējam to pilnībā izārstēt.

And there are two commonly given reasons

Parasti tiek minēti divi iemesli,

for why that happens.

kāpēc tā notiek.

One of them is it's early days.

Pirmais — mēs esam pašā atklājumu sākumā.

We're just learning the words, the fragments,

Mēs vēl tikai mācāmies vārdus, fragmentus,

the letters in the genetic code.

ģenētiskā koda „burtus”.

We don't know how to read the sentences.

Mēs vēl neprotam lasīt teikumus.

We don't know how to follow the narrative.

Mēs vēl nezinām, kā izprast stāstus.

The other reason given is that

Otrs iemesls —

vairums ģenētisko pārmaiņu izraisa kādas funkcijas zudumu,

most of those changes are a loss of function,

and it's actually really hard to develop drugs

un ir ļoti sarežģīti radīt zāles,

that restore function.

kas šo funkciju atjaunotu.

But today, I want us to step back

Bet šodien es gribētu paspert soli atpakaļ

and ask a more fundamental question,

un uzdot būtiskāku jautājumu:

and ask, "What happens if we're thinking

„Vai varētu būt,

ka mēs par šo visu domājam nepareizā kontekstā?”

about this maybe in the wrong context?"

We do a lot of studying of those who are sick

Mēs daudz pētām tos, kuri ir slimi,

and building up long lists

un veidojam garus sarakstus

of altered components.

ar ģenētiskajām izmaiņām.

But maybe, if what we're trying to do

Bet varbūt, ja reiz mēs mēģinām

is to develop therapies for prevention,

izveidot profilaktiskas terapijas,

maybe what we should be doing

mums patiesībā vajadzētu

is studying those who don't get sick.

pētīt tos cilvēkus, kuri nesaslimst.

Maybe we should be studying those

Varbūt mums vajadzētu pētīt tos,

that are well.

kuri ir veseli.

A vast majority of those people

Lielākā daļa šo cilvēku,

are not necessarily carrying a particular

iespējams, nemaz nav konkrētā gēna

genetic load or risk factor.

vai riska faktora nesēji.

They're not going to help us.

Tie mums nepalīdzēs.

There are going to be those individuals

Būs arī tādi cilvēki,

who are carrying a potential future risk,

kuri ir pakļauti potenciālam riskam nākotnē

they're going to go on to get some symptom.

un kuriem parādīsies kāds no simptomiem.

That's not what we're looking for.

To mēs nemeklējam.

What we're asking and looking for is,

Mēs patiesībā gribam noskaidrot un uzzināt,

are there a very few set of individuals

vai ir tādi nedaudzie cilvēki,

who are actually walking around

kuri dzīvo ar riska faktoru,

with the risk that normally would cause a disease,

kas parasti izraisa slimību,

but something in them, something hidden in them

bet kaut kas šajos cilvēkos

is actually protective

viņus aizsargā

and keeping them from exhibiting those symptoms?

un neļauj slimības simptomiem izpausties.

If you're going to do a study like that, you can imagine

Ja jūs izdomātu pētīt ko tamlīdzīgu,

you'd like to look at lots and lots of people.

jūs gribētu aplūkot ārkārtīgi daudz cilvēku.

We'd have to go and have a pretty wide study,

Tam būtu jābūt vērienīgam pētījumam,

and we realized that actually

un mēs sapratām,

one way to think of this is,

ka viens veids, kā to paveikt,

let us look at adults who are over 40 years of age,

ir pievērsties pieaugušajiem, kas vecāki par 40 gadiem,

and let's make sure that we look at those

un pārliecināties, ka pētām tikai tos,

who were healthy as kids.

kuri bija veseli arī bērnībā.

They might have had individuals in their families

Iespējams, viņu ģimenēs ir bijuši cilvēki,

who had had a childhood disease,

kas bērnībā cietuši no kādas slimības,

but not necessarily.

bet varbūt arī ne.

And let's go and then screen those

Tad nu pārbaudīsim šos cilvēkus,

to find those who are carrying genes

un atradīsim tos, kuri ir

for childhood diseases.

bērnu slimību gēnu nesēji.

Now, some of you, I can see you

Varu iztēloties, kā daži no jums

putting your hands up going, "Uh, a little odd.

paceļ rokas un jautā: „Ai, tas nu gan ir mazliet savādi!

What's your evidence

Kādi ir pierādījumi,

that this could be feasible?"

ka tas ir izdarāms?”

I want to give you two examples.

Es minēšu divus piemērus.

The first comes from San Francisco.

Pirmais ir no Sanfrancisko,

It comes from the 1980s and the 1990s,

tas ir no 80.—90. gadiem,

and you may know the story where

Varbūt jūs jau zināt stāstu

there were individuals who had very high levels

par cilvēkiem ar ļoti augstu

HIV vīrusa attīstības pakāpi.

of the virus HIV.

They went on to get AIDS.

Viņi saslima ar AIDS.

But there was a very small set of individuals

Tomēr bija arī neliels daudzums cilvēku,

who also had very high levels of HIV.

kuriem tāpat bija ļoti liels HIV vīrusu daudzums organismā

They didn't get AIDS.

Viņiem AIDS neattīstījās.

And astute clinicians tracked that down,

Vērīgākie ārsti to ievēroja

and what they found was they were carrying mutations.

un atklāja, ka šiem cilvēkiem ir ģenētiskas mutācijas.

Notice, they were carrying mutations from birth

Ņemiet vērā, ka šīs mutācijas bija viņos kopš dzimšanas,

that were protective, that were protecting them

tās viņus pasargāja

from going on to get AIDS.

no saslimšanas ar AIDS.

You may also know that actually a line of therapy

Jūs varbūt arī zināt,

ka ir parādījusies uz šo faktu balstīta terapija.

has been coming along based on that fact.

Second example, more recent, is elegant work

Otrs piemērs — ne tik sens —

ir Helēnas Hobsas brīnišķīgais darbs.

done by Helen Hobbs,

who said, "I'm going to look at individuals

Viņa sacīja: „Es pētīšu tos cilvēkus,

who have very high lipid levels,

kuriem ir ļoti augsts lipīdu līmenis,

and I'm going to try to find those people

un mēģināšu atrast cilvēkus

with high lipid levels

ar augstu lipīdu līmeni,

who don't go on to get heart disease."

kuriem neattīstās sirds slimības.”

And again, what she found was

Un arī viņa atklāja,

ka dažiem no šiem cilvēkiem bija ģenētiskas mutācijas,

some of those individuals had mutations

that were protective from birth that kept them,

kas par spīti lipīdu līmenim sargāja viņus kopš dzimšanas.

even though they had high lipid levels,

and you can see this is an interesting way

Kā redzat, šis ir interesants veids,

of thinking about how you could develop

kā domāt par jaunu terapiju izstrādi.

preventive therapies.

The project that we're working on

Projektu, pie kura mēs strādājam, sauc

is called "The Resilience Project:

„Noturības projekts: Negaidītu varoņu meklējumos”,

A Search for Unexpected Heroes,"

because what we are interested in doing is saying,

jo mēs esam ieinteresēti uzzināt,

can we find those rare individuals

vai varam atrast tos retos cilvēkus,

who might have these hidden protective factors?

kas sevī glabā šos aizsargājošos faktorus?

And in some ways, think of it as a decoder ring,

Savā ziņā varam to uztvert kā koda atslēgu —

a sort of resilience decoder ring

ģenētiskās noturības koda atslēgu,

that we're going to try to build.

ko mēs cenšamies radīt.

We've realized that we should do this in a systematic way,

Mēs sapratām, ka šis darbs ir jāveic sistemātiski,

so we've said, let's take every single

tādēļ izlēmām, ka ņemsim ikkatru

childhood inherited disease.

iedzimtu bērnu slimību.

Let's take them all, and let's pull them back a little bit

Ņemsim visas un atlasīsim tās,

by those that are known to have severe symptoms,

par kurām zinām, ka tās rada smagus simptomus,

where the parents, the child,

tātad gan vecāki, gan bērns, gan citi tuvinieki

those around them would know

that they'd gotten sick,

noteikti pamanītu saslimšanu.

and let's go ahead and then frame them again

Tad vēlreiz apskatīsim

by those parts of the genes where we know

tās gēnu daļas, par kurām zināms,

that there is a particular alteration

ka tajās ir īpašas pārmaiņas,

that is known to be highly penetrant

kas ir spējīgas izraisīt konkrēto slimību.

to cause that disease.

Where are we going to look?

Kur mēs meklēsim?

Well, we could look locally. That makes sense.

Nu, mēs varētu meklēt tepat tuvumā, tas šķiet prātīgi.

But we began to think, maybe we should look

Bet tad mēs sākām domāt, ka varbūt vajadzētu meklēt

all over the world.

visā pasaulē.

Maybe we should look not just here

Varbūt mums vajadzētu meklēt ne tikai šeit,

but in remote places where their might be

bet arī nomaļās vietās, kur varētu būt

a distinct genetic context,

īpaši ģenētiskie apstākļi,

there might be environmental factors

piemēram, vides faktori,

that protect people.

kas cilvēkus aizsargā.

And let's look at a million individuals.

Izpētīsim miljons cilvēku!

Now the reason why we think it's a good time

Iemesls, kādēļ mēs uzskatām,

to do that now

ka tieši tagad ir īstais laiks to darīt,

is, in the last couple of years,

ir tas, ka pēdējo gadu laikā

there's been a remarkable plummeting in the cost

ir strauji samazinājušās izmaksas

to do this type of analysis,

šāda veida analīžu veikšanai

this type of data generation,

un datu ievākšanai.

to where it actually costs less to do

Tagad ir pat lētāk

the data generation and analysis

savākt un analizēt datus

than it does to do the sample processing and the collection.

nekā ievākt un apstrādāt paraugus.

The other reason is that in the last five years,

Vēl viens iemesls — pēdējo piecu gadu laikā

there have been awesome tools,

ir parādījušies lieliski instrumenti

things about network biology, systems biology,

un atklājumi sistēmbioloģijā,

that have come up that allow us to think

kas ļauj mums domāt,

that maybe we could decipher

ka mēs varbūt varētu atšifrēt

those positive outliers.

šos pozitīvos izlecējus.

And as we went around talking to researchers

Tiekoties un runājot

and institutions

ar pētniekiem un iestādēm,

and telling them about our story,

stāstot viņiem par mūsu idejām,

something happened.

notika kas negaidīts.

They started saying, "This is interesting.

Viņi teica: „Interesanti.

I would be glad to join your effort.

Es ar prieku jums pievienošos.

I would be willing to participate."

Esmu gatavs piedalīties.”

And they didn't say, "Where's the MTA?"

Viņi neteica: „Kur ir materiālu nodošanas līgums?”

They didn't say, "Where is my authorship?"

Viņi neteica: „Kur ir manas autortiesības?”

They didn't say, "Is this data going to be mine? Am I going to own it?"

Viņi neprasīja: „Vai šie dati būs mani? Vai tie piederēs man?”

They basically said, "Let's work on this

Būtībā viņi teica:

„Strādāsim visi kopā kā atvērta komanda,

in an open, crowd-sourced, team way

to do this decoding."

lai paveiktu šo atšifrēšanas darbu.”

Six months ago, we locked down

Pirms sešiem mēnešiem mēs atradām

the screening key for this decoder.

šīs koda atslēgas atrisinājumu.

My co-lead, a brilliant scientist, Eric Schadt

Mans līdzvadītājs ģeniālais zinātnieks Ēriks Šadts

at the Icahn Mount Sinai School of Medicine in New York,

Aikanas Medicīnas skolā Mauntsinajā, Ņujorkā,

and his team,

kopā ar savu komandu

locked in that decoder key ring,

atklāja šī koda atslēgu.

and we began looking for samples,

Mēs sākām meklēt paraugus,

because what we realized is,

jo sapratām, ka varbūt varam

maybe we could just go and look

vienkārši ņemt un apskatīt gatavus paraugus,

at some existing samples to get some sense of feasibility.

lai gūtu priekšstatu par iespējām šādu ieceri īstenot.

Maybe we could take two, three percent of the project on,

Varbūt mēs varam paņemt 2—3% no projekta

un paskatīties, vai meklējamais tur vispār ir.

and see if it was there.

And so we started asking people

Mēs sākām aptaujāt tādus cilvēkus

such as Hakon at the Children's Hospital in Philadelphia.

kā Haukons Filadelfijas Bērnu slimnīcā.

We asked Leif up in Finland.

Mēs prasījām Leifam Somijā.

We talked to Anne Wojcicki at 23andMe,

Mēs runājām ar Annu Vodžiki no „23andMe”

and Wang Jun at BGI,

un Vangu Džunu no BGI,

and again, something remarkable happened.

un atkal notika kas vienreizīgs!

They said, "Huh,

Viņi teica: „Hm!

not only do we have samples,

Mums ne vien ir paši paraugi,

but often we've analyzed them,

mēs bieži vien tos jau esam analizējuši

and we would be glad to go into

un ar prieku pārskatīsim

our anonymized samples

mūsu anonīmos paraugus —

and see if we could find those

varbūt mums izdosies atrast tos,

that you're looking for."

kurus meklējat.”

And instead of being 20,000 or 30,000,

20 000 vai 30 000 vietā

last month we passed one half million samples

pagājušajā mēnesī mēs jau bijām izanalizējuši

vairāk nekā pusmiljonu paraugu.

that we've already analyzed.

So you must be going,

Jūs droši vien gribat vaicāt:

"Huh, did you find any unexpected heroes?"

„Nu, vai jūs atradāt kādus negaidītos varoņus?”

And the answer is, we didn't find one or two.

Atbilde ir — mēs atradām nevis vienu vai divus,

We found dozens of these strong candidate

mēs atradām desmitiem

šādu negaidīto varoņu kandidātu.

unexpected heroes.

So we think that the time is now

Tādēļ mēs domājam, ka ir pienācis laiks

to launch the beta phase of this project

ķerties pie projekta nākamās fāzes

and actually start getting prospective individuals.

un patiešām sākt meklēt atbilstošus cilvēkus.

Basically all we need is information.

Būtībā mums tik vien kā vajag informāciju.

We need a swab of DNA

Mums vajag DNS uztriepi

and a willingness to say, "What's inside me?

un vēlēšanos uzzināt: „Kas manī ir iekšā?

I'm willing to be re-contacted."

Es piekrītu, ka ar mani atkārtoti sazināsies.”

Most of us spend our lives,

Vairums no mums pavada dzīvi,

when it comes to health and disease,

vērojot no malas, kad runa ir par veselību un slimībām.

acting as if we're voyeurs.

We delegate the responsibility

Mēs nododam atbildību

for the understanding of our disease,

izprast mūsu slimību

for the treatment of our disease,

un to ārstēt

to anointed experts.

oficiāli atzītiem ekspertiem.

In order for us to get this project to work,

Lai šis projekts izdotos,

we need individuals to step up

mums vajag cilvēkus, kas ir gatavi

in a different role and to be engaged,

uzņemties citu lomu un iesaistīties,

to realize this dream,

lai īstenotu šo sapni,

this open crowd-sourced project,

šo atvērto pūļa projektu,

to find those unexpected heroes,

lai atrastu šos negaidītos varoņus,

to evolve from the current concepts

lai paceltos pāri mūsdienu pieņēmumiem

of resources and constraints,

par līdzekļiem un ierobežojumiem,

to design those preventive therapies,

lai radītu jaunas profilaktiskās terapijas

and to extend it beyond childhood diseases,

un piemērotu tās ne tikai bērnu kaitēm vien.

to go all the way up to ways

Lai nonāktu galā un atrastu veidus

that we could look at Alzheimer's or Parkinson's,

kā pētīt Alcheimera vai Pārkinsona slimību gēnus,

we're going to need us

vajag, lai mēs visi

to be looking inside ourselves and asking,

ieskatītos sevī un pajautātu:

"What are our roles?

„Kādas ir mūsu lomas?

What are our genes?"

Kādi ir mūsu gēni?”

and looking within ourselves for information

Mums ir jāmeklē sevī informācija,

we used to say we should go to the outside,

ko mēdzām meklēt ārpusē, pie ekspertiem,

to experts,

and to be willing to share that with others.

un jābūt gataviem ar šo informāciju dalīties.

Thank you very much.

Liels paldies!

(Aplausi)

(Applause)