Stephen Friend: The hunt for "unexpected genetic heroes"

Stephen Friend: La chasse aux « héros génétiques inattendus »

Traducteur: Morgane Quilfen Relecteur: Elise LECAMP

Approximately 30 years ago,

Il y a environ 30 ans,

when I was in oncology at the Children's Hospital

quand je travaillais en oncologie à l'hôpital pour enfants

in Philadelphia,

de Philadelphie,

a father and a son walked into my office

un père et son fils sont venus me voir dans mon bureau,

and they both had their right eye missing,

il leur manquait l’œil droit à tous les deux,

and as I took the history, it became apparent

quand j'ai pris leurs dossiers médicaux, il est devenu évident

that the father and the son had a rare form

que le père et le fils avaient une forme rare

of inherited eye tumor, retinoblastoma,

de tumeur oculaire héréditaire : un rétinoblastome,

and the father knew that he had passed that fate

et le père savait qu'il l'avait transmis

on to his son.

à son fils.

That moment changed my life.

Ce moment a changé ma vie.

It propelled me to go on

Il m'a poussé à aller de l'avant

and to co-lead a team that discovered

et à codiriger une équipe qui a découvert

the first cancer susceptibility gene,

la première gène de prédisposition au cancer.

and in the intervening decades since then,

Dans les décennies suivantes,

there has been literally a seismic shift

il y a eu un mouvement sismique

in our understanding of what goes on,

dans notre compréhension de ce qui se passe,

what genetic variations are sitting behind

quelles variations génétiques se cachent derrière

various diseases.

ces différentes maladies.

In fact, for thousands of human traits,

En fait, on connaît la molécule de base

a molecular basis that's known for that,

de milliers de caractéristiques humaines

and for thousands of people, every day,

et, chaque jour, des milliers de personnes

there's information that they gain

sont informées sur leurs risques

about the risk of going on to get this disease

d'avoir telle maladie

or that disease.

ou telle autre.

At the same time, if you ask,

Pourtant, si vous me demandez :

"Has that impacted the efficiency,

« Cela a-t-il impacté l'efficacité,

how we've been able to develop drugs?"

la manière dont nous avons été capables de développer des médicaments ? »

the answer is not really.

la réponse est « pas vraiment ».

If you look at the cost of developing drugs,

Si vous regardez le coût de la recherche pharmaceutique,

how that's done, it basically hasn't budged that.

à la façon dont c'est fait, ça n'a pas bougé.

And so it's as if we have the power to diagnose

C'est comme si nous avions le pouvoir de diagnostiquer

yet not the power to fully treat.

mais pas encore celui de traiter complètement.

And there are two commonly given reasons

Il y a deux raisons principales

for why that happens.

pour expliquer cela.

One of them is it's early days.

L'une d'entre elles est qu'il est encore tôt.

We're just learning the words, the fragments,

Nous venons d'apprendre les mots, les fragments,

the letters in the genetic code.

les lettres du code génétique.

We don't know how to read the sentences.

Nous ne savons pas lire les phrases.

We don't know how to follow the narrative.

Nous ne savons pas comment suivre la narration.

The other reason given is that

L'autre raison est que

most of those changes are a loss of function,

la plupart des changements entraînent une perte de fonction,

and it's actually really hard to develop drugs

et qu'il est très dur de développer des médicaments

that restore function.

qui restaureraient ces fonctions.

But today, I want us to step back

Mais aujourd'hui, je veux que nous prenions du recul

and ask a more fundamental question,

et que nous posions des questions plus fondamentales :

and ask, "What happens if we're thinking

« Que se passe-t-il si nous y réfléchissons

about this maybe in the wrong context?"

dans un mauvais contexte ? »

We do a lot of studying of those who are sick

Nous étudions beaucoup les personnes malades

and building up long lists

et nous créons de longues listes

of altered components.

de composants qui ont été modifiés.

But maybe, if what we're trying to do

Mais peut-être que si ce que nous essayons de faire

is to develop therapies for prevention,

est de trouver des traitements préventifs,

maybe what we should be doing

alors nous devrions

is studying those who don't get sick.

étudier les personnes qui ne sont pas malades.

Maybe we should be studying those

Peut-être que nous devrions étudier

that are well.

les personnes qui vont bien.

A vast majority of those people

Une grande majorité de ces personnes

are not necessarily carrying a particular

ne portent pas particulièrement

genetic load or risk factor.

de prédisposition génétique, n'ont pas de facteur de risques.

They're not going to help us.

Elles ne vont pas nous aider.

There are going to be those individuals

Elles vont faire partie de ces personnes

who are carrying a potential future risk,

qui ont un risque futur potentiel,

they're going to go on to get some symptom.

elles vont finir par développer des symptômes.

That's not what we're looking for.

Ce n'est pas ce que nous recherchons.

What we're asking and looking for is,

Ce que nous cherchons c'est :

are there a very few set of individuals

y a-t-il un tout petit nombre de personnes

who are actually walking around

qui se promènent

with the risk that normally would cause a disease,

avec un risque qui, normalement, entraînerait une maladie,

but something in them, something hidden in them

mais quelque chose en elles, quelque chose de caché en elles

is actually protective

les protège

and keeping them from exhibiting those symptoms?

et les empêche d'exposer ces symptômes ?

If you're going to do a study like that, you can imagine

Si vous faites une telle étude, vous pouvez imaginer

you'd like to look at lots and lots of people.

que vous aimeriez voir des tonnes et des tonnes de personnes.

We'd have to go and have a pretty wide study,

Nous devrions avoir une étude étendue,

and we realized that actually

nous nous sommes rendus compte

one way to think of this is,

qu'une façon d'y penser est :

let us look at adults who are over 40 years of age,

laissez-nous voir les adultes de plus de 40 ans,

and let's make sure that we look at those

et assurons-nous que nous voyons

who were healthy as kids.

ceux qui, enfants, étaient en bonne santé.

They might have had individuals in their families

Ils ont peut-être eu des personnes dans leur famille

who had had a childhood disease,

qui ont eu des maladies dans l'enfance,

but not necessarily.

mais pas nécessairement.

And let's go and then screen those

Allons-y et trouvons les personnes

to find those who are carrying genes

qui portent des gènes de prédisposition

for childhood diseases.

pour une maladie de l'enfance.

Now, some of you, I can see you

Je peux déjà voir certains d'entre vous

putting your hands up going, "Uh, a little odd.

lever la main et dire : « Un peu bizarre.

What's your evidence

Quelle preuve avez-vous

that this could be feasible?"

que c'est faisable ? »

I want to give you two examples.

Je vais vous donner deux exemples.

The first comes from San Francisco.

Le premier vient de San Francisco.

It comes from the 1980s and the 1990s,

Dans les années 1980 et 1990,

and you may know the story where

vous connaissez sûrement l'histoire,

there were individuals who had very high levels

des personnes étaient très fortement atteintes

of the virus HIV.

par le VIH.

They went on to get AIDS.

Elles ont eu le SIDA.

But there was a very small set of individuals

Mais une minorité de ces personnes

who also had very high levels of HIV.

ayant aussi des niveaux très élevés de VIH

They didn't get AIDS.

n'ont pas eu le SIDA.

And astute clinicians tracked that down,

D'astucieux cliniciens ont cherché ces personnes

and what they found was they were carrying mutations.

et ils ont trouvé qu'elles avaient des mutations génétiques.

Notice, they were carrying mutations from birth

Remarquez que depuis leur naissance elles avaient ces mutations

that were protective, that were protecting them

qui les protégeaient

from going on to get AIDS.

du SIDA.

You may also know that actually a line of therapy

Vous savez peut-être qu'un traitement

has been coming along based on that fact.

a été développé en se basant sur ce fait-là.

Second example, more recent, is elegant work

Deuxième exemple, plus récent, un travail élégant

done by Helen Hobbs,

d'Helen Hobbs

who said, "I'm going to look at individuals

qui a dit : « Je vais me pencher sur les personnes

who have very high lipid levels,

qui ont des niveaux de lipides très élevés,

and I'm going to try to find those people

je vais essayer de trouver des personnes

with high lipid levels

avec des niveaux de lipides élevés

who don't go on to get heart disease."

et qui n'ont pas de maladie cardiaque. »

And again, what she found was

Et encore une fois, elle a trouvé que

some of those individuals had mutations

certaines de ces personnes avaient des mutations génétiques

that were protective from birth that kept them,

depuis la naissance qui les protégeaient,

even though they had high lipid levels,

même si elles avaient des niveaux de lipides élevés,

and you can see this is an interesting way

vous voyez que c'est une vision intéressante

of thinking about how you could develop

sur la façon de développer

preventive therapies.

des traitements préventifs.

The project that we're working on

Le projet sur lequel nous travaillons

is called "The Resilience Project:

est appelé : « Le projet Résilience :

A Search for Unexpected Heroes,"

à la recherche des héros inattendus »,

because what we are interested in doing is saying,

parce que ce qui nous intéresse c'est :

can we find those rare individuals

pouvons-nous trouver ces rares personnes

who might have these hidden protective factors?

qui ont ces facteurs protecteurs cachés ?

And in some ways, think of it as a decoder ring,

D'une façon, pensez-y comme à un anneau de décodage

a sort of resilience decoder ring

une sorte d'anneau de décodage de la résilience

that we're going to try to build.

que nous allons essayer de construire.

We've realized that we should do this in a systematic way,

Nous nous sommes rendus compte que nous devions faire ça de façon systématique,

so we've said, let's take every single

nous nous sommes dit :

considérons chaque maladie d'enfance héréditaire.

childhood inherited disease.

Let's take them all, and let's pull them back a little bit

Considérons les toutes et prenons un peu de recul

by those that are known to have severe symptoms,

pour celles qui ont des symptômes sévères,

where the parents, the child,

où les parents, les enfants,

those around them would know

les gens autour d'eux sauraient

that they'd gotten sick,

qu'ils sont malades,

and let's go ahead and then frame them again

et allons de l'avant, reconsidérons-les

by those parts of the genes where we know

par le biais de ces morceaux de gènes que nous savons

that there is a particular alteration

être modifiés

that is known to be highly penetrant

d'une façon particulièrement pénétrante

to cause that disease.

pour être la cause de cette maladie.

Where are we going to look?

Où allons-nous chercher ?

Well, we could look locally. That makes sense.

On pourrait chercher à l'échelle locale. Ça aurait un sens.

But we began to think, maybe we should look

Mais nous commençons à penser que peut-être nous devrions chercher

all over the world.

partout dans le monde.

Maybe we should look not just here

Peut-être ne devrions-nous pas simplement regarder ici

but in remote places where their might be

mais dans des lieux éloignés où il y aura peut-être

a distinct genetic context,

un contexte génétique différent,

there might be environmental factors

des facteurs environnementaux

that protect people.

qui protègent les gens.

And let's look at a million individuals.

Regardons un million de personnes.

Now the reason why we think it's a good time

Nous pensons que maintenant, c'est le bon moment

to do that now

pour faire ceci parce que,

is, in the last couple of years,

au cours des dernières années,

there's been a remarkable plummeting in the cost

le prix de ce type d'analyse,

to do this type of analysis,

de ce type de production de base de données,

this type of data generation,

a remarquablement baissé

to where it actually costs less to do

jusqu'au point que cela coûte moins cher

the data generation and analysis

de générer les données et de faire l'analyse

than it does to do the sample processing and the collection.

que de procéder à l'échantillonnage et ensuite de collecter les données.

The other reason is that in the last five years,

L'autre raison est que, au cours des cinq dernières années,

there have been awesome tools,

des outils étonnants,

things about network biology, systems biology,

des choses comme les réseaux et systèmes biologiques,

that have come up that allow us to think

qui sont apparus et qui nous font croire

that maybe we could decipher

que peut-être nous pourrions déchiffrer

those positive outliers.

ces singularités positives.

And as we went around talking to researchers

Alors que nous parlions à des chercheurs

and institutions

et des institutions

and telling them about our story,

et que nous leur racontions notre histoire,

something happened.

quelque chose s'est produit.

They started saying, "This is interesting.

Ils ont commencé à dire : « C'est intéressant.

I would be glad to join your effort.

Je serais heureux de me joindre à vous.

I would be willing to participate."

Je serais prêt à participer. »

And they didn't say, "Where's the MTA?"

Ils ne disaient pas : « Où est la MTA ? »

They didn't say, "Where is my authorship?"

ou bien : « Qu'en est-il de mon droit d'auteur ? »

They didn't say, "Is this data going to be mine? Am I going to own it?"

Ils ne disaient pas : « Ces données seront-elles à moi ? »

They basically said, "Let's work on this

Ils disaient : « Travaillons là-dessus

in an open, crowd-sourced, team way

dans un esprit d'équipe et de partage

to do this decoding."

pour réussir ce déchiffrement. »

Six months ago, we locked down

Il y a six mois, nous avons verrouillé

the screening key for this decoder.

la clé de sélection pour ce décodeur.

My co-lead, a brilliant scientist, Eric Schadt

Mon co-dirigeant, un brillant scientifique, Eric Schadt

at the Icahn Mount Sinai School of Medicine in New York,

de l'école de médecine du Mont Icahn de Sinaï à New York,

and his team,

et son équipe,

locked in that decoder key ring,

ont verrouillé la clé de l'anneau de décodage,

and we began looking for samples,

nous avons commencé à chercher des échantillons,

because what we realized is,

parce que nous nous sommes rendus compte

maybe we could just go and look

que peut-être nous pourrions regarder

at some existing samples to get some sense of feasibility.

des échantillons existant pour avoir une idée de la faisabilité.

Maybe we could take two, three percent of the project on,

Peut-être pourrions-nous prendre 2-3% des projets en cours,

and see if it was there.

et voir si ça fonctionne.

And so we started asking people

Nous avons commencé à demander à des gens

such as Hakon at the Children's Hospital in Philadelphia.

comme Hakon de l'Hôpital pour enfants de Philadelphie.

We asked Leif up in Finland.

Nous avons demandé à Leif en Finlande.

We talked to Anne Wojcicki at 23andMe,

Nous avons parlé à Anne Wojcicki de 23andMe,

and Wang Jun at BGI,

à Wang Jun du BGI,

and again, something remarkable happened.

et, de nouveau, quelque chose de remarquable s'est produit.

They said, "Huh,

Ils ont dit :

not only do we have samples,

« Non seulement nous avons les échantillons

but often we've analyzed them,

mais nous les avons souvent analysés

and we would be glad to go into

et nous serions heureux de revenir

our anonymized samples

à nos échantillons anonymisés

and see if we could find those

et de voir si nous pouvons trouver

that you're looking for."

ceux que vous cherchez. »

And instead of being 20,000 or 30,000,

Et au lieux de 20 000 ou 30 000 échantillons,

last month we passed one half million samples

le mois dernier nous avons dépassé le demi million

that we've already analyzed.

d'échantillons analysés.

So you must be going,

Vous allez sûrement demander :

"Huh, did you find any unexpected heroes?"

« Avez-vous trouvé un héros génétique inattendu ? »

And the answer is, we didn't find one or two.

Et la réponse est : nous n'en avons pas trouvé deux ou trois.

We found dozens of these strong candidate

Nous avons trouvé des douzaines de candidats au titre

unexpected heroes.

de héros inattendu.

So we think that the time is now

Nous pensons qu'il est temps

to launch the beta phase of this project

de lancer la phase bêta du projet

and actually start getting prospective individuals.

et de commencer à voir des candidats éventuels.

Basically all we need is information.

Tout ce dont nous avons besoin, c'est d'informations.

We need a swab of DNA

Nous avons besoin d'échantillons d'ADN

and a willingness to say, "What's inside me?

et d'une envie de dire : « Qu'y a-t-il en moi ?

I'm willing to be re-contacted."

Je veux être contacté à nouveau. »

Most of us spend our lives,

La plupart d'entre nous passons notre vie,

when it comes to health and disease,

quand il est question de santé ou de maladie,

acting as if we're voyeurs.

à agir comme un voyeur.

We delegate the responsibility

Nous déléguons la responsabilité

for the understanding of our disease,

de la compréhension de nos maladies

for the treatment of our disease,

et de leur traitement

to anointed experts.

à des experts choisis.

In order for us to get this project to work,

Pour faire fonctionner ce projet,

we need individuals to step up

nous avons besoin que les gens s'engagent

in a different role and to be engaged,

dans un rôle différent et qu'ils participent,

to realize this dream,

pour réaliser ce rêve,

this open crowd-sourced project,

ce projet libre,

to find those unexpected heroes,

pour trouver ces héros inattendus,

to evolve from the current concepts

pour évoluer au-delà des concepts actuels

of resources and constraints,

de contraintes et de ressources,

to design those preventive therapies,

pour développer ces traitements préventifs,

and to extend it beyond childhood diseases,

et pour étendre cela au-delà des maladies de l'enfance,

to go all the way up to ways

pour aller jusqu'à considérer

that we could look at Alzheimer's or Parkinson's,

les maladies d'Alzheimer ou de Parkinson,

we're going to need us

nous allons avoir besoin

to be looking inside ourselves and asking,

de regarder en nous et de demander :

"What are our roles?

« Quels sont nos rôles ?

What are our genes?"

Quels sont nos gènes ? »

and looking within ourselves for information

De chercher en nous-même des informations.

we used to say we should go to the outside,

Nous disions qu'il fallait chercher à l'extérieur,

to experts,

aller voir des experts,

and to be willing to share that with others.

et il faudrait accepter de partager ces informations avec les autres.

Thank you very much.

Merci beaucoup.

(Applause)

(Applaudissements)