3 ways to end a virus

Traducteur: Claire Ghyselen Relecteur: eric vautier

It’s spring 2021.

Printemps 2021.

The Alpha variant of the coronavirus has spread rapidly,

Le variant Alpha du coronavirus s’est répandu rapidement,

becoming the dominant variant worldwide.

devenant ainsi le variant dominant dans le monde.

But another, more transmissible variant is about to appear—

Mais une autre variant plus transmissible, est en train de se développer : Delta.

Delta.

What happens when two variants clash?

Que se passe-t-il lorsque deux variants s'affrontent ？

Let’s do a thought experiment.

Faisons cet exercice mental.

Suppose that the variants reach a hypothetical isolated city

imaginons que les variants atteignent une ville isolée hypothétique

of 1 million people who are completely susceptible to both viruses

d'un million de personnes sensibles aux deux virus, le même jour.

on the same day.

When a person here is infected with Alpha, they transmit it to,

Lorsqu'une personne est contaminée par Alpha,

elle le transmet en moyenne à cinq contacts proches,

on average, 5 close contacts,

then begin to feel sick and immediately isolate themselves

puis elle commence à se sentir malade et s'isole immédiatement,

for the rest of the simulation.

pour le reste de la simulation.

The same thing happens with Delta,

La même chose se produit avec Delta,

except that an infected person transmits it to, on average, 7.5 close contacts.

sauf qu'une personne contaminée le transmet à 7,5 contacts proches.

What would you guess happens next?

Que pensez-vous qu'il va se passer ?

After six days, Alpha will have infected 15,625 people.

En six jours, Alpha aura contaminé 15 625 personnes.

Delta will have infected more than 10 times as many.

Delta en aura contaminé 10 fois plus.

Just 20 hours later, Delta will have infected the rest of the population—

20 heures plus tard, Delta aura contaminé le reste de la population -

all before Alpha could infect 6% of it.

avant qu’Alpha n’ait pu en contaminer 6%.

With no one left to infect, Alpha dies out.

Sans personne à contaminer, Alpha meurt.

This model is drastically simplified,

Ce modèle est certes radicalement simplifié,

but it accurately reflects one thing that did happen in real life:

mais il reflète fidèlement un phénomène qui s'est produit dans la réalité :

when both variants competed,

lorsque les deux variants sont en concurrence,

Delta drove Alpha towards extinction in a matter of weeks.

Delta a exterminé Alpha en quelques semaines.

Viruses are wildly successful organisms.

Les virus sont des organismes très vivaces.

There are about 100 million times as many virus particles on Earth

Il y a 100 millions de fois plus de particules virales sur Terre

as there are stars in the observable universe.

qu’il y a d’étoiles dans l'univers observable.

Even so, viruses can and do go extinct.

Malgré tout, les virus peuvent disparaître et ça arrive.

There are three main ways that can happen.

Il y a trois principales raisons.

First, a virus could run out of hosts.

D’abord, un virus peut ne plus trouver d’hôte.

This might have happened in early 2020 to a flu lineage known as B/Yamagata.

Cela aurait pu se produire début 2000 à une espèce de grippe : B/Yamagata.

When much of the world shut down, social distanced, and wore masks

Le confinement, la distanciation sociale et le port du masque

to slow the spread of COVID 19,

afin d’empêcher la propagation du COVID-19

that dramatically reduced the number of hosts available for B/Yamagata to infect.

eurent pour effet de réduire drastiquement

le nombre d’hôtes disponibles pour B/Yamagata.

It’ll take a few more flu seasons to know for sure

Il faudra quelques saisons grippales pour déterminer

if it’s truly extinct or just hiding out in an animal reservoir.

s’il est définitivement exterminé ou s’il se cache dans un animal.

Many viruses, as part of their life cycle,

De nombreux virus, dans leur cycle de leur vie,

cause diseases severe enough to kill their hosts.

provoquent des maladies suffisamment graves pour tuer leurs hôtes.

This can be a problem because if a virus kills all its hosts,

C’est un souci pour le virus car s’il tue son hôte,

it could— in theory— run out of hosts to infect and go extinct.

il pourrait - en théorie - ne plus en trouver et périr faute d’hôte.

This almost happened back in 1950s Australia.

C’est ce qui est presque survenu en Australie en 1950.

At the time, Australia was overrun by the European rabbit— an invasive species—

À l’époque, l’Australie était envahie par le lapin européen, une espèce invasive.

so, in an attempt to control the population,

Dans une tentative pour en contrôler la population,

scientists released a virus called myxoma,

les scientifiques ont libéré un virus appelé myxomatose,

which had been previously shown to be almost 100% lethal to European rabbits.

qui avait fait ses preuves en termes d’extermination des lapins européens.

During the initial outbreak,

Pendant la pandémie initiale,

as planned, tens, perhaps hundreds, of millions of European rabbits died.

des dizaines, voire des centaines de millions de lapins périrent, comme prévu.

But as the virus spread, it evolved a series of mutations

Mais en se diffusant, le virus a évolué en plusieurs mutants,

that happened to make it less deadly,

ce qui rendit les infections moins létales.

killing rabbits more slowly and killing fewer rabbits overall.

Les lapins mouraient plus lentement et en plus petit nombre.

With more infected hosts hopping around,

Avec davantage d’hôtes contaminés gambadant partout,

this strain of the virus was more likely to spread than its deadlier cousin.

cette nouvelle espèce du virus était plus susceptible de se répandre

que son cousin plus mortel.

And of course, rabbits evolved too, to mount better immune responses.

Or les lapins aussi évoluèrent pour améliorer leur réaction immunitaire.

Overall, instead of killing every single rabbit,

Au lieu de tuer tous les lapins,

the virus evolved, the rabbit population bounced back,

le virus évolua, la population de lapins se régénéra

and both survived.

et les deux survécurent.

The second way a virus could go extinct

La deuxième façon qui mène à l’extinction d’un virus,

is if humans fight back with an effective vaccine—

c’est un vaccin efficace qui gagne le combat.

and win.

Vaccination campaigns have driven two viruses essentially to extinction

Les campagnes de vaccination ont éliminé deux virus

since vaccines were invented in the 1800s:

depuis l’invention des vaccins dans les années 1800 :

smallpox and rinderpest, which kills cattle.

la variole et la peste bovine, qui tue les bovins.

More on vaccination later.

Nous reparlerons des vaccins.

The third way a virus can go extinct is if it’s outcompeted

La troisième façon de périr pour un virus est sa mise en concurrence

by another virus or strain,

avec une autre espèce virale, plus robuste,

like we saw earlier with Delta and Alpha.

comme nous l’avons vu avec Alpha et Delta.

By the way, viruses don't always compete with each other.

Attention, les virus ne sont pas forcément en compétition.

A viral species can carve out its own distinct niche—

Une espèce virale peut créer sa propre niche personnelle,

for example, influenza infects your respiratory tract,

comme par exemple, la grippe qui contamine le système respiratoire,

and norovirus infects cells in your intestine,

ou le norovirus qui contamine les cellules intestinales.

so both of these viruses can co-exist.

Ces deux virus peuvent co-exister.

A virus’ ecological niche can be tiny:

Une niche écologique d’un virus peut être très petite aussi.

hepatitis B and hepatitis C viruses can infect the same cell—

L’hépatite B et l’hépatite C infectent la même cellule,

hep B occupies the nucleus, and hep C occupies the cytoplasm.

mais B envahit le noyau et C le cytoplasme.

In fact, epidemiologists estimate that 2 to 10% of people with hep C

Les épidémiologistes estiment que 2 à 10% des personnes ayant une hépatite C

are also infected with hep B.

ont aussi une hépatite B.

So, will SARS-CoV-2—

Alors, que va-t-il se passer avec SARS-CoV-2,

the species of virus that causes COVID 19—

l’espèce virale qui cause le COVID-19 ?

ever go extinct?

S’éteindra-t-elle ?

Variants within the species will continue to arise.

Des variants de cette espèce continueront d’apparaître.

Those variants might drive prior ones to extinction, or not.

Ces variants pourraient mener à l’extinction leurs prédécesseurs, ou pas.

Regardless of how the variants compete (or don’t),

Que les variants entrent en concurrence ou pas,

the species itself— to which all the variants belong—

l’espèce elle-même, celle à laquelle appartiennent les variants,

is pretty firmly established among humans.

est bien ancrée parmi les humains.

If we managed to vaccinate enough people, could we drive SARS-CoV-2 to extinction?

En vaccinant suffisamment de personnes, pourrions-nous exterminer SARS-CoV-2 ?

Our vaccination campaign against smallpox worked

Nos campagnes de vaccination contre la variole furent efficaces

because the vaccine was highly protective against infection

car le vaccin protégeait très bien de la contamination

and smallpox had no close animal reservoir in which it could hide.

et la variole n’avait pas d’animal pour l’abriter.

But SARS-CoV-2 can hide out in animals,

Mais SARS-CoV-2 peut se cacher dans les animaux

and our current vaccines—

et nos vaccins actuels,

while they provide excellent protection against severe illness and death—

même s’ils nous protègent très bien des symptômes graves et de la mort,

don't prevent all infections.

n’empêchent pas la contamination.

So, conceivably there are two ways that SARS-CoV-2—

Dès lors, il reste deux façons pour mener SARS-CoV-2 vers l’extinction,

the entire species— could go extinct:

toute l’espèce :

a cataclysmic disaster could kill us all.

une catastrophe cataclysmique qui nous tuerait tous.

Or...

Ou...

We could invent a universal vaccine that prevents all SARS-CoV-2 infections—

l’invention d’un vaccin universel qui empêche la contamination du SARS-CoV-2,

those caused by all the variants that currently exist and those that don’t.

et de tous ses variants qui existent et qui n’existent pas.

Let's work toward that second option.

Faisons en sorte que ce soit cette deuxième option.