Joe DeRisi: Hunting the next killer virus

ジョー・デリシ：ウイルス・スキャンが解く医学の謎

翻訳: Rinko Kawakami 校正: Mamoru Ichikawa

How can we investigate

どうしたら私たちの周りにある

this flora of viruses that surround us, and aid medicine?

様々なウイルスを調べ 医学に役立てられるでしょうか？

How can we turn our cumulative knowledge of virology

また 膨大なウイルス学の知識を

into a simple, hand-held, single diagnostic assay?

ひとつの ポータブルな検査に まとめられるでしょうか？

I want to turn everything we know right now about detecting viruses

ウイルスや ウイルス検出知識の全てを

and the spectrum of viruses that are out there

例えばこのような

into, let's say, a small chip.

小さなチップに 凝縮したいと考えています

When we started thinking about this project --

このようなプロジェクト—

how we would make a single diagnostic assay

ひとつの検査で

to screen for all pathogens simultaneously --

同時に 多種の病原体を 検知する考えには

well, there's some problems with this idea.

通常 いくつかの問題があります

First of all, viruses are pretty complex,

ウイルスはかなり複雑な上

but they're also evolving very fast.

急速に進化しています

これはピコルナウイルスです

This is a picornavirus.

Picornaviruses -- these are things that include

ピコルナウイルスの仲間には

the common cold and polio, things like this.

感冒やポリオを 引き起こすものもあります

You're looking at the outside shell of the virus,

これはウイルスの外観です

and the yellow color here are those parts of the virus

黄色い部分はウイルスの

that are evolving very, very fast,

急速に進化している部分です

and the blue parts are not evolving very fast.

青い部分は急激に 変化していません

When people think about making pan-viral detection reagents,

幅広いウイルス検出の 試薬の開発では

usually it's the fast-evolving problem that's an issue,

ウイルスが常に 進化し続けていることが

because how can we detect things if they're always changing?

問題になるものです

But evolution is a balance:

しかし進化にはバランスがあり

where you have fast change, you also have ultra-conservation --

激しく進化する 部分がある一方で

ほとんど変化しない 部分もあります

things that almost never change.

And so we looked into this a little more carefully,

そこで 我々は ここに注目しました

データをお見せします

and I'm going to show you data now.

This is just some stuff you can do on the computer from the desktop.

普通のパソコンで できるものです

I took a bunch of these small picornaviruses,

感冒やポリオなどを引き起こす

like the common cold, like polio and so on,

様々なピコルナウイルスを

and I just broke them down into small segments.

小さな部分に分けました

And so took this first example, which is called coxsackievirus,

まず コクサッキーウイルスの例ですが

and just break it into small windows.

細かく分けた塩基配列の

And I'm coloring these small windows blue

青で示した部分は

if another virus shares an identical sequence in its genome

他のウイルスのゲノム中にもある 同一の塩基配列です

to that virus.

他のウイルスのゲノム中にもある 同一の塩基配列です

These sequences right up here --

ここの配列を見てください

which don't even code for protein, by the way --

タンパク質をコードしてさえ いませんが

are almost absolutely identical across all of these,

この種のウイルス全体に 完全に一致しています

so I could use this sequence as a marker

この塩基配列をマーカーとすれば

to detect a wide spectrum of viruses,

個々のウイルスの検出を行わずに

without having to make something individual.

この種に属するウイルスを 幅広く検出できます

Now, over here there's great diversity:

この辺は 配列が多様な

that's where things are evolving fast.

急速に進化している場所です

Down here you can see slower evolution: less diversity.

ゆっくり進化している部分では 多様性が少ないのです

一方で 例えば

Now, by the time we get out here to, let's say,

急性ミツバチ麻痺ウイルスには

acute bee paralysis virus --

probably a bad one to have if you're a bee ---

ミツバチの方は 避けたいウイルスですが

this virus shares almost no similarity to coxsackievirus,

コクサッキーウイルスとの共通点は ほとんど ありません

but I can guarantee you that the sequences that are most conserved

でも このような 共通性の少ない 画面右側のウイルスでも

among these viruses on the right-hand of the screen

保存されている領域は

are in identical regions right up here.

この部分であるはずです

And so we can encapsulate these regions of ultra-conservation

そこでウイルスが どのように進化したかを示す

through evolution -- how these viruses evolved --

この進化上の「超保存領域」を ひとまとめにして

by just choosing DNA elements or RNA elements

この領域のDNAや RNAの塩基配列を選んで

in these regions to represent on our chip as detection reagents.

検出用試薬としてチップに 使うことができます

OK, so that's what we did, but how are we going to do that?

では どうやって このチップを作ったか

Well, for a long time, since I was in graduate school,

大学院生だった頃から

I've been messing around making DNA chips --

DNAチップの作成を いろいろ試していました

that is, printing DNA on glass.

DNAをガラスに プリントするのです

And that's what you see here:

小さな白い点が

These little salt spots are just DNA tacked onto glass,

ガラス上のDNAです

and so I can put thousands of these on our glass chip

何千ものDNAスポットを ガラスのチップにのせて

検出試薬として 使用できるのです

and use them as a detection reagent.

チップをヒューレット パッカード社にある

We took our chip over to Hewlett-Packard

and used their atomic force microscope on one of these spots,

原子間力顕微鏡を使って 見てみると

and this is what you see:

原子間力顕微鏡を使って 見てみると

you can actually see the strands of DNA lying flat on the glass here.

DNA鎖がガラスの上に ついているのが見えます

So, what we're doing is just printing DNA on glass --

ガラスにDNAを プリントしているのです

little flat things -- and these are going to be markers for pathogens.

これらのDNA鎖が 病原体のマーカーとなります

OK, I make little robots in lab to make these chips,

チップを作る 小型ロボットも作っています

and I'm really big on disseminating technology.

テクノロジーの普及は とても大切だと思います

If you've got enough money to buy just a Camry,

カムリ級の車を買う お金があれば

you can build one of these too,

このロボットが作れます

and so we put a deep how-to guide on the Web, totally free,

ウェブ上に無料で 詳しい作り方を載せていますので

with basically order-off-the-shelf parts.

市販の部品を使って 皆さんも

You can build a DNA array machine in your garage.

自宅のガレージで DNAチップ製造機が作れるわけです

Here's the section on the all-important emergency stop switch.

これは緊急停止ボタンのつくり方です

(Laughter)

（笑）

Every important machine's got to have a big red button.

どんな重要な機械も 大きな赤いボタンが必要です

But really, it's pretty robust.

とてもがっしりした機械です

You can actually be making DNA chips in your garage

ガレージでDNAのチップが 作れるのです

and decoding some genetic programs pretty rapidly. It's a lot of fun.

遺伝子のプログラムをすばやく解読できて とっても楽しいですよ

(Laughter)

（笑）

And so what we did -- and this is a really cool project --

とても素晴らしい プロジェクトです

we just started by making a respiratory virus chip.

呼吸器系ウイルスチップ の作製を 始めました

I talked about that --

先に話しましたように

you know, that situation where you go into the clinic

病院に行っても

and you don't get diagnosed?

診断がつかない時です

そこで 呼吸器系の ウイルス全てと

Well, we just put basically all the human respiratory viruses

on one chip, and we threw in herpes virus for good measure --

比較のためヘルペスウイルスも のせました

I mean, why not?

邪魔にはなりません

The first thing you do as a scientist is,

科学者として まずすることは

実験がうまくいくのを 確かめることです

you make sure stuff works.

And so what we did is, we take tissue culture cells

そこで 組織培養細胞に

and infect them with various viruses,

様々なウイルスに感染させ

and we take the stuff and fluorescently label the nucleic acid,

培養細胞から出て来る遺伝物質― 主にウイルス由来の核酸ですが

the genetic material that comes out of these tissue culture cells --

それを蛍光標識し

mostly viral stuff -- and stick it on the array to see where it sticks.

ウイルスアレイの どこに結合するか見ます

DNAの塩基配列が合えば くっつくので

Now, if the DNA sequences match, they'll stick together,

and so we can look at spots.

スポットを観察すると

もし光るスポットがあれば 特定のウイルスの存在を示します

And if spots light up, we know there's a certain virus in there.

That's what one of these chips really looks like,

お見せしているのが そのチップです

and these red spots are, in fact, signals coming from the virus.

赤いスポットは ウイルスからの信号です

And each spot represents a different family of virus

それぞれのスポットは 違う科または種の ウイルスを表しています

それぞれのスポットは 違う科または種の ウイルスを表しています

or species of virus.

And so, that's a hard way to look at things,

これは手の込んだ観察法です

so I'm just going to encode things as a little barcode,

ウイルスの科ごとに 短いバーコードで表示して

grouped by family, so you can see the results in a very intuitive way.

結果が直観的に 得られるようにします

What we did is, we took tissue culture cells

アデノウイルスに感染させた

and infected them with adenovirus,

組織培養細胞を調べてみると

and you can see this little yellow barcode next to adenovirus.

アデノウイルスの所に 黄色いバーコードが見えるでしょう

And, likewise, we infected them with parainfluenza-3 --

同様にパラインフルエンザ３型— パラミクソウイルスですが その感染細胞は

that's a paramyxovirus -- and you see a little barcode here.

ここの小さなバーコード

And then we did respiratory syncytial virus.

RSウイルスでも試しました

That's the scourge of daycare centers everywhere --

このウイルスは全国の保育所の 悩みの種です

it's like boogeremia, basically.

このウイルスは全国の保育所の 悩みの種です

(Laughter)

（笑）

You can see that this barcode is the same family,

同じ科であっても

重症になる パラインフルエンザ３型とは

but it's distinct from parainfluenza-3,

which gives you a very bad cold.

全く違うのがわかります

And so we're getting unique signatures, a fingerprint for each virus.

ウイルスの指紋といえる 独特のサインが得られるのです

Polio and rhino: they're in the same family, very close to each other.

ポリオとライノは同科で とても似ています

Rhino's the common cold, and you all know what polio is,

ライノウィルスは感冒の原因 ポリオはご存じのとおり

and you can see that these signatures are distinct.

でも それぞれを 区別することができます

And Kaposi's sarcoma-associated herpes virus

カポジ肉腫に合併する ヘルペスウイルスが

gives a nice signature down here.

独特のサインを示しています

And so it is not any one stripe or something

ひとつの縞模様ではなく

that tells me I have a virus of a particular type here;

バーコードを全体として 見ることで

it's the barcode that in bulk represents the whole thing.

ウイルスが特定できるのです

さて 一種類のライノウイルス に 注目します

All right, I can see a rhinovirus --

and here's the blow-up of the rhinovirus's little barcode --

そのライノウイルスのバーコードを 拡大したものです

but what about different rhinoviruses?

異なるライノウイルスでは どうでしょう

How do I know which rhinovirus I have?

どの種に感染しているか 分かるでしょうか？

There're 102 known variants of the common cold,

研究者が集めた限りでは

感冒には102もの類似種が 関連しています

and there're only 102 because people got bored collecting them:

there are just new ones every year.

毎年 新しいウイルスが 見つかります

And so, here are four different rhinoviruses,

ここには４種類の ライノウイルスがあります

and you can see, even with your eye,

肉眼でも

パターン照合を行う 複雑なコンピューターの

without any fancy computer pattern-matching

recognition software algorithms,

認識ソフトアルゴリズムがなくても

that you can distinguish each one of these barcodes from each other.

バーコードを 識別することができます

Now, this is kind of a cheap shot,

これはちょっと ズルをしています

これらのライノウイルス遺伝子の 塩基配列を

because I know what the genetic sequence of all these rhinoviruses is,

全部知っていたので それを使って

and I in fact designed the chip

expressly to be able to tell them apart,

チップをデザインすれば 良かったからです

but what about rhinoviruses that have never seen a genetic sequencer?

では 遺伝子の塩基配列が 分からないものではどうでしょう？

新しく見つかったものの配列は わかりません

We don't know what the sequence is; just pull them out of the field.

So, here are four rhinoviruses

この４つのライノウイルスは

we never knew anything about --

未知のもので

no one's ever sequenced them -- and you can also see

塩基配列も解析されていませんが

それぞれ独特のパターンを 持っています

that you get unique and distinguishable patterns.

You can imagine building up some library, whether real or virtual,

全てのウイルスの「指紋」を収集し

of fingerprints of essentially every virus.

情報ライブラリーが できるかもしれません

But that's, again, shooting fish in a barrel, you know, right?

でもこれもまだ いけすで魚釣りをする程 簡単すぎます

You have tissue culture cells. There are a ton of viruses.

組織培養から得られた ウイルスではなく

What about real people?

実際の人間でも この方法は使えるでしょうか？

You can't control real people, as you probably know.

人間の状況はそれぞれ違い

You have no idea what someone's going to cough into a cup,

採取する唾液や痰などにも 何が混じっているかわかりません

and it's probably really complex, right?

しかも とても複雑です

It could have lots of bacteria, it could have more than one virus,

たくさんのウイルスや細菌

and it certainly has host genetic material.

また人間の遺伝物質も 混ざっています

So how do we deal with this?

では どうすれば

And how do we do the positive control here?

テストの陽性コントロールを 作れるか？

Well, it's pretty simple.

実は簡単です

That's me, getting a nasal lavage.

私が鼻洗浄を 受けているところです

And the idea is, let's experimentally inoculate people with virus.

要は 実験的にウイルスを 感染させてみようということです

This is all IRB-approved, by the way; they got paid.

治験審査委員会の承認済みですし 被験者に報酬も払っています

And basically we experimentally inoculate people

基本的には 感冒ウイルスを

実験的に感染させます

with the common cold virus.

Or, even better, let's just take people

もっと良いのは 患者を救急室から

right out of the emergency room --

連れてくることです

undefined, community-acquired respiratory tract infections.

原因不明の市中で感染した 気道感染症の患者です

You have no idea what walks in through the door.

本当にどんな患者が 病院にやってくるか分かりません

So, let's start off with the positive control first,

ではウイルスを感染させた人から 始めましょう

where we know the person was healthy.

健康な人の

They got a shot of virus up the nose,

鼻からウイルスを注入すると

どうなるか見てみましょう

let's see what happens.

Day zero: nothing happening.

初日：何も起こっていません

健康でウイルスも 見つかりません

They're healthy; they're clean -- it's amazing.

健康そうにしていても

Actually, we thought the nasal tract might be full of viruses

注入したのでウイルスが いっぱいと思っていたのに

even when you're walking around healthy.

It's pretty clean. If you're healthy, you're pretty healthy.

ほとんど何もありません まったく健康そうです

Day two: we get a very robust rhinovirus pattern,

２日目：はっきりした ライノウイルスのパターンが見られます

研究室の組織培養実験のものと とても似ています

and it's very similar to what we get in the lab

doing our tissue culture experiment.

はっきりしたパターンが見える

So that's great, but again, cheap shot, right?

でも まだこれも 実験としては ずるをしているようなものです

We put a ton of virus up this guy's nose. So --

膨大な量のウイルスを 注入したんですから

(Laughter)

（笑）

-- I mean, we wanted it to work. He really had a cold.

実験成功のためでしたが 実際 彼は風邪をひいてしまいました

So, how about the people who walk in off the street?

では 病院に来る患者は どうでしょう

Here are two individuals represented by their anonymous ID codes.

匿名IDで識別される ２名の患者です

They both have rhinoviruses; we've never seen this pattern in lab.

２人ともライノウイルスに 感染しています

We sequenced part of their viruses;

かつて誰も見たことのない

they're new rhinoviruses no one's actually even seen.

新しいライノウイルスです

Remember, our evolutionary-conserved sequences

先ほどの 進化の中で 保持された配列

we're using on this array allow us to detect

この配列を使えば

even novel or uncharacterized viruses,

新しく未研究なウイルスも 検知できます

because we pick what is conserved throughout evolution.

進化を通じて保持された部分を 調べるからです

Here's another guy. You can play the diagnosis game yourself here.

ちょっと診断ゲームを してみましょう

These different blocks represent

ここに示したウィルスたちは

the different viruses in this paramyxovirus family,

パラミクソウイルスの仲間です

so you can kind of go down the blocks

それぞれのウイルスの

and see where the signal is.

どれに反応が出ているでしょうか

Well, doesn't have canine distemper; that's probably good.

幸い 犬ジステンパーではない様です

(Laughter)

（笑）

But by the time you get to block nine,

しかし９番ブロックを見てみると

you see that respiratory syncytial virus.

RSウイルスであるのが分かります

Maybe they have kids. And then you can see, also,

家に小さなお子さんが いるのかもしれません

the family member that's related: RSVB is showing up here.

また 関連したウイルスの RSVBも見つかりました

So, that's great.

すばらしいです

Here's another individual, sampled on two separate days --

こちらの患者から別々の日に

repeat visits to the clinic.

２回サンプルを採取しました

This individual has parainfluenza-1,

パラインフルエンザ１型に 患っていました

and you can see that there's a little stripe over here

ここに見える 縞でわかるのは

for Sendai virus: that's mouse parainfluenza.

センダイウイルス マウスパラインフルエンザの一種です

The genetic relationships are very close there. That's a lot of fun.

遺伝的関連性が非常にあり 面白いでしょう

So, we built out the chip.

今まで

We made a chip that has every known virus ever discovered on it.

発見された全てのウイルス

植物ウイルス 昆虫ウイルス 海洋ウイルス

Why not? Every plant virus, every insect virus, every marine virus.

Everything that we could get out of GenBank --

国の遺伝子データバンクから 得られる

that is, the national repository of sequences.

すべての配列を このチップに収めました

Now we're using this chip. And what are we using it for?

このようなチップの用途を 説明します

Well, first of all, when you have a big chip like this,

この様な膨大なチップは

you need a little bit more informatics,

インフォーマティクスが 必要になってきます

so we designed the system to do automatic diagnosis.

自動診断をするシステムを 考案しました

And the idea is that we simply have virtual patterns,

仮想のパターンを 使うシステムです

because we're never going to get samples of every virus --

全てのウイルスの サンプルを得るのは

it would be virtually impossible. But we can get virtual patterns,

不可能ですが 仮想パターンを使って

and compare them to our observed result --

実際の結果と比較し

which is a very complex mixture -- and come up with some sort of score

とても複雑なパターンを 点数化するわけです

of how likely it is this is a rhinovirus or something.

それがライノウイルスである 可能性はどれくらいか？

And this is what this looks like.

という具合にです

If, for example, you used a cell culture

例えばパピローマウイルスに

that's chronically infected with papilloma,

慢性感染している 培養細胞を使い

you get a little computer readout here,

コンピューター解析してみます

and our algorithm says it's probably papilloma type 18.

アルゴリズムが示したのは パピローマ18型

まさに この培養細胞が

And that is, in fact, what these particular cell cultures

are chronically infected with.

感染しているウイルスでした

So let's do something a little bit harder.

少々難しい課題に 挑戦しましょう

私たちは 診断がつかない患者が

We put the beeper in the clinic.

When somebody shows up, and the hospital doesn't know what to do

病院に来た時に 連絡するよう

because they can't diagnose it, they call us.

サンフランシスコ近郊の病院に

That's the idea, and we're setting this up in the Bay Area.

頼んであります

And so, this case report happened three weeks ago.

３週間前にあったケースです

We have a 28-year-old healthy woman, no travel history,

喫煙も飲酒もしない

旅行歴のない健康な 28歳の女性です

[unclear], doesn't smoke, doesn't drink.

10-day history of fevers, night sweats, bloody sputum --

症状は 10日間の発熱 寝汗に血痰

she's coughing up blood -- muscle pain.

喀血や筋肉痛もありました

She went to the clinic, and they gave her antibiotics

病院へ行き 抗生物質を 処方されました

and then sent her home.

そして帰宅

She came back after ten days of fever, right? Still has the fever,

ところが熱は下がらず 10日後 再び病院へ行くと

and she's hypoxic -- she doesn't have much oxygen in her lungs.

低酸素血症― 肺に十分な酸素がありません

They did a CT scan.

CTスキャンの結果です

A normal lung is all sort of dark and black here.

健康な肺は全体的に 黒っぽく写ります

All this white stuff -- it's not good.

白いところはすべて 良くない所です

This sort of tree and bud formation indicates there's inflammation;

この木とつぼみのような影は 炎症のあることを示します

there's likely to be infection.

感染の可能性大です

OK. So, the patient was treated then

第３世代セファロスポリン系 抗生物質や

with a third-generation cephalosporin antibiotic and doxycycline,

ドキシサイクリンを 投与し３日経っても

and on day three, it didn't help: she had progressed to acute failure.

効果がなく 呼吸不全に陥り

挿管が必要となり

They had to intubate her, so they put a tube down her throat

人工呼吸機器を装着しました

and they began to mechanically ventilate her.

She could no longer breathe for herself.

自分では呼吸できない 状態だったのです

What to do next? Don't know.

次の手段は？ 分かりません

Switch antibiotics: so they switched to another antibiotic,

さらに抗生物質を変えました

Tamiflu.

なぜインフルエンザだと

It's not clear why they thought she had the flu,

思ったのかわかりませんが

but they switched to Tamiflu.

タミフルに変更されました

And on day six, they basically threw in the towel.

６日目には他に手立てがなく

You do an open lung biopsy when you've got no other options.

開胸肺生検が行われました

There's an eight percent mortality rate with just doing this procedure,

検査だけでも8%の死亡率です

and so basically -- and what do they learn from it?

何がわかったのでしょうか？

You're looking at her open lung biopsy.

これが検査結果です

And I'm no pathologist, but you can't tell much from this.

病理医でなくとも

All you can tell is, there's a lot of swelling: bronchiolitis.

多くの腫脹を伴う 気管支炎のあることが分かります

It was "unrevealing": that's the pathologist's report.

結論は「原因不明」

And so, what did they test her for?

病院独自の検査で

They have their own tests, of course,

70種類以上の分析が

and so they tested her for over 70 different assays,

行われました

for every sort of bacteria and fungus and viral assay

細菌・カビ類・ ウイルスに関する

you can buy off the shelf:

既存の検査の全てです

SARS, metapneumovirus, HIV, RSV -- all these.

SARS､メタニューモウイルス､ HIV､RSVもです

Everything came back negative, over 100,000 dollars worth of tests.

10万ドル以上かかりましたが 全て「陰性」でした

I mean, they went to the max for this woman.

病院側としては 出来る限りのことをしたのです

And basically on hospital day eight, that's when they called us.

8日目に 私たちに連絡があり

They gave us endotracheal aspirate --

気管内吸引のサンプルを 受け取りました

you know, a little fluid from the throat,

挿管チューブから 採取した液体です

from this tube that they got down there -- and they gave us this.

挿管チューブから 採取した液体です

We put it on the chip; what do we see? Well, we saw parainfluenza-4.

その液体をチップに 載せたところ なんと

パラインフルエンザ４型が 現れました

Well, what the hell's parainfluenza-4?

No one tests for parainfluenza-4. No one cares about it.

普通 パラインフルエンザ４型の テストはしません

In fact, it's not even really sequenced that much.

塩基配列も ほんの少ししか解明されておらず

There's just a little bit of it sequenced.

疫学的にも

ほとんど研究されていなかった

There's almost no epidemiology or studies on it.

No one would even consider it,

誰もそれが呼吸不全を 起こすとは

because no one had a clue that it could cause respiratory failure.

思わなかったからです

And why is that? Just lore. There's no data --

どうしてでしょう？ この例も一つの逸話にすぎません

no data to support whether it causes severe or mild disease.

病気が軽症であるとも 重症化するともデータがありません

Clearly, we have a case of a healthy person that's going down.

でも 今回 健康な人でも 重症になることがわかりました

OK, that's one case report.

でも 一つの症例報告にすぎません

I'm going to tell you one last thing in the last two minutes

さて 最後の２分間で

that's unpublished -- it's going to come out tomorrow --

明日 発表される研究について お話します

and it's an interesting case of how you might use this chip

このチップが 新たな発見のために

to find something new and open a new door.

応用しうることを 示したケースです

Prostate cancer. I don't need to give you many statistics

「前立腺がん」については

皆さんよくご存じでしょう

about prostate cancer. Most of you already know it:

米国でのがん死因の第３位

third leading cause of cancer deaths in the U.S.

Lots of risk factors,

多くの危険因子がありますが

but there is a genetic predisposition to prostate cancer.

その一つが「遺伝的要因」です

前立腺がんの約10%は

For maybe about 10 percent of prostate cancer,

there are folks that are predisposed to it.

遺伝が関わっています

And the first gene that was mapped in association studies

早期発症型の前立腺がんには

for this, early-onset prostate cancer, was this gene called RNASEL.

RNASELという 遺伝子が関わっています

What is that? It's an antiviral defense enzyme.

抗ウイルス防衛酵素を 作るものです

So, we're sitting around and thinking,

そこで考えました

"Why would men who have the mutation --

抗ウイルス防衛システムに 欠陥があると

a defect in an antiviral defense system -- get prostate cancer?

なぜ前立腺がんを患うのか？

It doesn't make sense -- unless, maybe, there's a virus?"

ウイルスの影響が あるのでしょうか？

So, we put tumors --- and now we have over 100 tumors -- on our array.

そこで100例を超える腫瘍由来DNAを チップで分析してみました

And we know who's got defects in RNASEL and who doesn't.

RNASELの欠陥者のものがどれか わかっています

And I'm showing you the signal from the chip here,

信号が陽性となる チップの部分は

and I'm showing you for the block of retroviral oligos.

レトロウイルスの 塩基配列でした

抗ウイルス防衛システムに 欠陥があり

And what I'm telling you here from the signal, is

that men who have a mutation in this antiviral defense enzyme,

がんを患った男性からは

40%の確率で

and have a tumor, often have -- 40 percent of the time --

未知の レトロウイルスが 陽性になりました

a signature which reveals a new retrovirus.

ちょっとした発見と 思いませんか？

OK, that's pretty wild. What is it?

そこで このウイルスを クローン化しました

So, we clone the whole virus.

First of all, I'll tell you that a little automated prediction told us

コンピューターの自動解析では

ネズミのウイルスと非常に 似ているということしか

it was very similar to a mouse virus.

わかりませんでした

But that doesn't tell us too much,

so we actually clone the whole thing.

そこでウイルス全体を クローン化したのです

And the viral genome I'm showing you right here?

これがウイルスのゲノムです

It's a classic gamma retrovirus, but it's totally new;

典型的な ガンマレトロウイルスですが

誰も見たことのないものです

no one's ever seen it before.

Its closest relative is, in fact, from mice,

一番似ているのは マウスのウイルスです

and so we would call this a xenotropic retrovirus,

そこで このウイルスを マウス以外の動物に感染するので

because it's infecting a species other than mice.

「異種指向性レトロウイルス」と 呼ぶことにしました

And this is a little phylogenetic tree

これは 他のウイルスとの関係を表す

to see how it's related to other viruses.

進化系統樹です

We've done it for many patients now,

数多くの患者で調べた結果

and we can say that they're all independent infections.

感染源はすべて 個々のものだと言えます

同じウイルスですが

They all have the same virus,

but they're different enough that there's reason to believe

異なり方から

個別に感染したと考えられます

that they've been independently acquired.

このウイルスは 本当に がんの中にあったのか？ そうです

Is it really in the tissue? And I'll end up with this: yes.

We take slices of these biopsies of tumor tissue

がんを取り出し 組織を薄く切って

and use material to actually locate the virus,

ウイルスの存在場所を 特定したところ

and we find cells here with viral particles in them.

ウイルス粒子を持つ 細胞が見つかりました

患者はまさに ウイルスに 感染していたのです

These guys really do have this virus.

Does this virus cause prostate cancer?

このウイルスが前立腺がんの 原因なのでしょうか？

Nothing I'm saying here implies causality. I don't know.

まだ 因果関係は分かりません

Is it a link to oncogenesis? I don't know.

発がんとの関連はわかりません

Is it the case that these guys are just more susceptible to viruses?

これらの患者が ウイルスに侵されやすいのでしょうか？

Could be. And it might have nothing to do with cancer.

可能性はありますが がんとは無関係かも知れません

しかし あくまで可能性です

But now it's a door.

We have a strong association between the presence of this virus

現段階では ウイルスの存在と

がんに関連する遺伝子の変異に 強い繋がりがある

and a genetic mutation that's been linked to cancer.

それしかわかりません

That's where we're at.

So, it opens up more questions than it answers, I'm afraid,

調べれば調べるほど 疑問が膨らむ

but that's what, you know, science is really good at.

そこが科学の強いところです

This was all done by folks in the lab --

これは研究室にいる

皆の努力の成果です

I cannot take credit for most of this.

This is a collaboration between myself and Don.

これは私と ドンの共同研究

This is the guy who started the project in my lab,

これがこのプロジェクトを 始めた仲間

これが前立腺関係の 研究をしている仲間です

and this is the guy who's been doing prostate stuff.

Thank you very much. (Applause)

ありがとうございました（拍手）