The microbial jungles all over the place (and you) - Scott Chimileski and Roberto Kolter

Les jungles microbiennes partout (et vous) - Scott Chimileski et Roberto Kolter

Traducteur: Andrew Livera Relecteur: veronique colin

As we walk through our daily environments,

Lorsque nous marchons dans nos environnements quotidiens,

we're surrounded by exotic creatures

nous sommes entourés des créatures exotiques

that are too small to see with the naked eye.

qui sont trop petites pour être visibles à I'oeil nu.

We usually imagine these microscopic organisms, or microbes,

On imagine habituellement ces organismes microscopiques, ou microbes,

as asocial cells that float around by themselves.

comme des cellules asociales qui flottent par elles-mêmes.

But in reality, microbes gather by the millions

Mais en réalité, des microbes se rassemblent par millions

to form vast communities known as biofilms.

pour former de vastes communautés appelées biofilms.

Natural biofilms are like miniature jungles

Des biofilms naturels ressemblent à des jungles miniatures

filled with many kinds of microbes from across the web of life.

remplies de toutes sortes de microbes issus du réseau de la vie.

Bacteria and archaea mingle with other microbes

Les bactéries et les archées se mêlent à d'autres microbes

like algae, fungi, and protozoa,

comme les algues, les champignons et les protozoaires,

forming dense, organized structures that grow on almost any surface.

formant des structures denses et organisées

qui poussent sur presque toutes les surfaces.

Quand vous traversez sur la pointe des pieds une rivière,

When you pad across a river bottom,

touch the rind of an aged cheese,

touchez la croûte d'un vieux fromage,

tend your garden soil,

entretenez votre jardin,

or brush your teeth,

ou quand vous brossez vos dents,

you're coming into contact with these invisible ecosystems.

vous entrez en contact avec ces écosystèmes invisibles.

To see how biofilms come about,

Pour voir comment les biofilms adviennent,

let's watch one as it develops on a submerged river rock.

observons-en un se développer sur un rocher immergé de rivière.

This type of biofilm might begin with a few bacteria

Ce type de biofilm peut commencer avec quelques bactéries

swimming through their liquid environment.

nageant dans leur environnement liquide.

The cells use rotating flagella to propel towards the surface of the rock,

Les cellules utilisent des flagelles rotatives

pour se propulser à la surface de la roche

which they attach to with the help of sticky appendages.

à laquelle ils s'attachent à l'aide d'appendices collantes.

Then, they start producing an extracellular matrix

Ensuite, ils commencent à produire une matrice extracellulaire

that holds them together as they divide and reproduce.

qui les maintient ensemble, pendant qu'ils se divisent et se reproduisent.

Before long, microcolonies arise,

Rapidement, des microcolonies se développent,

clusters of cells sheathed in this slimy, glue-like material.

agrégats de cellules enveloppés dans ce matériau visqueux et collant.

Microcolonies grow to become towers,

Les microcolonies grandissent pour devenir des tours,

while water channels flow around them,

tandis que des canaux d'eau coulent autour d'eux,

functioning like a basic circulatory system.

fonctionnant comme un système circulatoire de base.

But why do microbes build such complex communities

Mais pourquoi les microbes construisent-ils des communautés aussi complexes

when they could live alone?

alors qu'ils pourraient vivre seul ?

For one thing, microbes living in a biofilm

D'abord, les microbes vivant dans un biofilm

are rooted in a relatively stable microenvironment

sont enracinées dans un microenvironnement relativement stable

où ils peuvent avoir accès à une source de substance nutritive.

where they may have access to a nutrient source.

There's also safety in numbers.

Il y a aussi la sécurité en nombre.

Out in the deep, dark wilderness of the microbial world,

Dans le vaste monde sauvage et sombre du monde microbien,

isolated microbes face serious risks.

les microbes isolés sont confrontés à de grands risques.

Predators want to eat them,

Des prédateurs veulent les manger,

immune systems seek to destroy them,

des systèmes immunitaires cherchent à les détruire,

and there are physical dangers, too,

et il y a aussi des dangers physiques:

like running out of water and drying up.

être à court d'eau et se dessécher.

However, in a biofilm, the extracellular matrix

En revanche, dans un biofilm, la matrice extracellulaire

shields microbes from external threats.

protège des microbes contre les menaces extérieures.

Biofilms also enable interactions between individual cells.

Les biofilms permettent aussi les

interactions entre les cellules individuelles.

When microbes are packed against each other in close proximity,

Lorsque des microbes sont tassés les uns contre les autres,

they can communicate,

ils peuvent communiquer,

exchange genetic information,

échanger de l'information génétique,

and engage in cooperative and competitive social behaviors.

et adopter des comportements sociaux coopératifs et compétitifs.

Take the soil in your garden,

Prenez le sol dans votre jardin,

home to thousands of bacterial species.

qui abrite des milliers d'espèces de bactéries.

As one species colonizes a plant root,

Comme une espèce colonise une racine de une plante,

its individual cells might differentiate into various subpopulations,

ses cellules individuelles peuvent se différencier en diverses sous-populations,

each carrying out a specific task.

chaque sous-population exécutant une tâche spécifique.

Matrix producers pump out the extracellular goo,

Les producteurs de la matrice pompent la matière extracellulaire,

swimmers assemble flagella and are free to move about or migrate,

les nageurs assemblent des flagelles et sont libres de se déplacer ou migrer,

and spore-formers produce dormant, tough endospores

et les formateurs de spores produisent des endospores dormants et durs

that survive starvation,

qui survivent à la famine,

temperature extremes,

aux températures extrêmes,

and harmful radiation.

et aux rayonnements nocifs.

This phenomenon is called division of labor.

Ce phénomène est appelé la division du travail.

Ultimately, it gives rise to a sophisticated system of cooperation

En fin de compte, il donne lieu à un système sophistiqué de coopération

that's somewhat like a multicellular organism in itself.

qui est un peu comme un organisme multicellulaire en soi.

But because biofilms often contain many different microbes

Mais comme les biofilms contiennent souvent

de nombreux des microbes différents

that aren't closely related to each other,

qui ne sont pas étroitement liés les uns aux autres,

interactions can also be competitive.

les interactions peuvent aussi être compétitives.

Bacteria launch vicious attacks on their competitors

Les bactéries lancent des attaques brutales contre leurs concurrents

by secreting chemicals into the environment,

en sécrétant des substances chimiques dans l'environnement,

or by deploying molecular spears to inject nearby cells with toxins

ou en déployant des lances moléculaires

pour injecter des cellules voisines avec des toxines

that literally blow them up.

qui les explosent littéralement.

In the end, competition is all about resources.

En fin de compte, la compétition ne concerne que les ressources.

If one species eliminates another,

Si une espèce élimine l'autre,

it keeps more space and food for itself.

elle conserve plus d'espace et de la nourriture pour elle-même.

Although this dramatic life cycle occurs beyond the limits of our vision,

Bien que ce cycle de vie dramatique

apparaît au-delà des limites de notre vision,

microbial communities provide humans and other species with tangible,

les communautés microbiennes fournissent aux humains et aux autres espèces

and sometimes even delicious, benefits.

des avantages tangibles, et parfois même délicieux.

Microbes make up a major fraction of the biomass on Earth

Microbes représentent une fraction majeure de la biomasse sur la Terre

and play a critical role within the global ecosystem

et ils jouent un rôle essentiel dans l'écosystème mondial

that supports all larger organisms,

qui soutient tous les grands organismes,

y compris nous.

including us.

Ils produisent une grande partie de l'oxygène que l'on respire,

They produce much of the oxygen we breath,

et ils sont recrutés pour nettoyer la pollution

and are recruited to clean up environmental pollution, like oil spills,

de l'environnement, comme les déversements de pétrole,

or to treat our waste water.

ou pour traiter nos eaux usées.

Not to mention, biofilms are normal and flavor enhancing parts

Sans parler, des biofilms sont des acteurs courants et aromatisants

of many of the foods we enjoy,

de la plupart des aliments que nous aimons,

including cheese,

y compris le fromage,

salami,

le salami,

and kombucha.

et le kombucha.

Donc, la prochaine fois que vous vous brossez les dents,

So the next time you brush your teeth,

mordez dans cette croûte de fromage,

bite into that cheese rind,

sift through garden soil,

tamisez le sol de jardin,

or skip a river stone,

ou frôlez un caillou de rivière,

look as close as you can.

regardez aussi près que possible.

Imagine the microbial jungles all around you

Imaginez les jungles microbiennes tout autour de vous

waiting to be discovered and explored.

attendant d'être découvertes et explorées.