Barry Schuler: An introduction to genomics

Barry Schuler: Genomics 101

Traducteur: brigitte VANNIER Relecteur: eric vautier

What's happening in genomics,

Ce qui est en train de se passer en génomique,

and how this revolution is about to change everything we know

et comment cette révolution va changer tout ce que nous savons

about the world, life, ourselves, and how we think about them.

sur le monde, sur la vie, sur nous-mêmes, et comment nous y pensons.

If you saw 2001: A Space Odyssey,

Si vous avez vu "2001, l’Odyssée de l’espace",

and you heard the boom, boom, boom, boom, and you saw the monolith,

et que vous avez entendu le "Boum boum boum" et vu le monolithe,

you know, that was Arthur C. Clarke's representation

c'était la représentation d'Arthur C. Clarke

that we were at a seminal moment in the evolution of our species.

comme quoi nous étions à un moment clé de l'évolution de notre espèce.

In this case, it was picking up bones and creating a tool,

Il s'agissait alors de prendre un os, de créer un outil,

using it as a tool, which meant that apes just, sort of,

de l'utiliser en tant que tel, ce qui signifiait que ces singes qui

running around and eating and doing each other

couraient dans tous les sens, mangeaient, et faisaient l'amour,

figured out they can make things if they used a tool.

comprenaient qu'ils pourraient faire des choses s'ils utilisaient un outil.

And that moved us to the next level.

Ceci nous a amené à un niveau supérieur.

And, you know, we in the last 30 years in particular

Depuis les 30 dernières années particulièrement,

have seen this acceleration in knowledge and technology,

nous avons vécu cette accélération de la connaissance et de la technologie,

and technology has bred more knowledge and given us tools.

technologie qui a généré plus de connaissance et nous a donné des outils.

And we've seen many seminal moments.

Nous avons vécu plusieurs moments clés.

We've seen the creation of small computers in the '70s and early '80s,

Il y a eu la création des ordinateurs personnels dans les années 70 et 80,

and who would have thought back then that every single person

qui aurait cru alors que chaque personne

would not have just one computer but probably 20,

aurait non pas un mais 20 ordinateurs,

in your home, and in not just your P.C. but in every device --

dans sa maison, pas seulement dans un PC mais dans chaque appareil --

in your washing machine, your cell phone.

dans la machine à laver, le téléphone mobile.

You're walking around; your car has 12 microprocessors.

Vous vous promenez, votre voiture a 12 microprocesseurs.

Then we go along and create the Internet

Puis, on a continué, on a créé Internet

and connect the world together; we flatten the world.

et connecté le monde; nous avons aplati le monde.

We've seen so much change, and we've given ourselves these tools now --

Nous avons vu tellement de changements, nous nous sommes donnés ces outils --

these high-powered tools --

des outils très puissants --

that are allowing us to turn the lens inward

qui nous permettent de retourner le microscope vers nous-mêmes

into something that is common to all of us, and that is a genome.

sur quelque chose qui nous est commun à tous, qui est le génome.

How's your genome today? Have you thought about it lately?

Comment va votre génome aujourd'hui? Avez-vous pensez à lui récemment?

Heard about it, at least? You probably hear about genomes these days.

Sans doute, vous en avez au moins entendu parler en ce moment.

I thought I'd take a moment to tell you what a genome is.

Je pensais passer un moment à vous expliquer ce qu'est un génome.

It's, sort of, like if you ask people,

C'est comme de demander aux gens

Well, what is a megabyte or megabit? And what is broadband?

"Qu'est qu'un mégabit? qu'est-ce que la bande passante?"

People never want to say, I really don't understand.

Les gens n'osent jamais dire, je ne comprends pas vraiment.

So, I will tell you right off of the bat.

Eh bien je vais vous l'expliquer.

You've heard of DNA; you probably studied a little bit in biology.

Vous avez entendu parler de l'ADN . Vous l'avez probablement étudié en biologie.

A genome is really a description for all of the DNA that is in a living organism.

Un génome est la description de tout l'ADN d'un organisme vivant.

And one thing that is common to all of life is DNA.

Le point commun à toutes les formes de vie est l'ADN.

It doesn't matter whether you're a yeast;

Que vous soyez une levure,

it doesn't matter whether you're a mouse;

une souris,

doesn't matter whether you're a fly; we all have DNA.

une mouche, on a tous un ADN.

The DNA is organized in words, call them: genes and chromosomes.

L'ADN est organisé en mots que l'on pourrait appeler gènes et chromosomes.

And when Watson and Crick in the '50s

Quand Watson et Crick dans les années 50

first decoded this beautiful double helix that we know as the DNA molecule --

ont décodé les premiers la magnifique double-hélice de la molécule d'ADN --

very long, complicated molecule --

molécule très longue, compliquée --

we then started on this journey to understand that

on a commencé ce cheminement vers la compréhension

inside of that DNA is a language that determines the characteristics, our traits,

du langage, à l'intérieur de l'ADN, qui détermine les caractéristiques, les traits,

what we inherit, what diseases we may get.

dont nous héritons, les maladies que nous pouvons développer.

We've also along the way discovered that this is a very old molecule,

Nous avons aussi découvert que c'est une très vieille molécule,

that all of the DNA in your body has been around forever,

que tout l'ADN dans notre corps existe depuis toujours,

since the beginning of us, of us as creatures.

depuis le début de notre histoire en tant qu'espèce.

There is a historical archive.

C'est une archive historique.

Living in your genome is the history of our species,

Notre génome est l'histoire de notre espèce,

and you as an individual human being, where you're from,

votre histoire en tant qu'individu, votre origine

going back thousands and thousands and thousands of years,

remontant sur des milliers et des milliers d'années,

and that's now starting to be understood.

c'est que nous commençons à comprendre.

But also, the genome is really the instruction manual.

Mais le génome est aussi la notice d'utilisation..

It is the program. It is the code of life.

C'est le programme, le code de la vie.

It is what makes you function;

Cela vous permet de vivre,

it is what makes every organism function.

cela permet à n'importe quel organisme de vivre.

DNA is a very elegant molecule.

L'ADN est une molécule très élégante.

It's long and it's complicated.

Une molécule très longue et compliquée.

Really all you have to know about it is that there's four letters:

Tout ce que vous devez vraiment savoir sur l'ADN est qu'il est composé de 4 lettres:

A, T, C, G; they represent the name of a chemical.

A, T, C, G, elles représentent chacune le nom d'un composé chimique.

And with these four letters, you can create a language:

Avec ces quatre lettres vous pouvez créer un langage:

a language that can describe anything, and very complicated things.

un langage qui puisse tout décrire, les choses les plus compliquées.

You know, they are generally put together in pairs,

Elles sont généralement réunies en paires,

creating a word or what we call base pairs.

ce que l'on appelle les paires de base.

And you would, you know, when you think about it,

Si vous pouviez, si vous y réfléchissez,

four letters, or the representation of four things, makes us work.

4 lettres, ou plus exactement la représentation de 4 choses, nous font fonctionner.

And that may not sound very intuitive,

Cela n'est peut-être pas très intuitif,

but let me flip over to something else you know about, and that's computers.

mais tournons-nous vers quelque chose que vous connaissez, l'informatique.

Look at this screen here and, you know, you see pictures

Regardez cet écran ici, vous voyez des images,

and you see words, but really all there are are ones and zeros.

vous voyez des mots mais en réalité, ce sont des 0 et des 1.

The language of technology is binary;

Le langage de cette technologie est binaire;

you've probably heard that at some point in time.

vous avez sans doute déjà entendu cela.

Everything that happens in digital is converted,

Tout ce qui se passe dans le monde numérique est converti,

or a representation, of a one and a zero.

ou représenté par des 0 et des 1.

So, when you're listening to iTunes and your favorite music,

Quand vous écoutez votre musique favorite sur iTunes,

that's really just a bunch of ones and zeros playing very quickly.

ce sont juste des 0 et des 1 qui sont joués très rapidement.

When you're seeing these pictures, it's all ones and zeros,

Quand vous regardez ces images, ce sont juste des 0 et des 1,

and when you're talking on your telephone, your cell phone,

quand vous parlez au téléphone ou sur votre mobile,

and it's going over the network,

cela va sur le réseau,

your voice is all being turned into ones and zeros and magically whizzed around.

votre voix est transformée en 0 et 1 et est transportée magiquement sur le réseau.

And look at all the complex things and wonderful things

Remarquez toutes les autres choses compliquées et merveilleuses

we've been able to create with just a one and a zero.

que nous avons pu créer avec des 0 et des 1.

Well, now you ramp that up to four, and you have a lot of complexity,

Eh bien, passez à 4 lettres et vous avez une complexité encore plus grande,

a lot of ways to describe mechanisms.

beaucoup de façons de décrire des mécanismes.

So, let's talk about what that means.

Voyons un peu ce que cela veut dire.

So, if you look at a human genome,

Si vous observez un génome humain,

they consist of 3.2 billion of these base pairs. That's a lot.

il est constitué de 3,2 milliards de paires de bases. C'est beaucoup.

And they mix up in all different fashions,

Ces paires de bases sont arrangées de différentes façons,

and that makes you a human being.

qui font de vous un être humain.

If you convert that to binary, just to give you a little bit of sizing,

Convertissez ça en binaire, juste pour donner une idée de dimensionnement,

we're actually smaller than the program Microsoft Office.

c'est en fait plus petit que le logiciel Microsoft Office.

It's not really all that much data.

Ça ne fait pas tant de données que cela.

I will also tell you we're at least as buggy.

Je vous dirai que nous sommes aussi buggés.

(Laughter)

(Rires)

This here is a bug in my genome

C'est un bug dans mon génome

that I have struggled with for a long, long time.

avec lequel je me bats pendant longtemps.

When you get sick, it is a bug in your genome.

Quand vous êtes malade, c'est un bug dans votre génome.

In fact, many, many diseases we have struggled with for a long time,

En fait, il y a beaucoup de maladies avec lesquelles nous luttons depuis longtemps,

like cancer, we haven't been able to cure

comme le cancer, que nous avons été incapables de guérir

because we just don't understand how it works at the genomic level.

parce que nous ne comprenons pas ce qui se passe au niveau génomique.

We are starting to understand that.

C'est ce que nous commençons à comprendre.

So, up to this point we tried to fix it

Jusqu'à aujourd'hui, nous avons essayé de réparer cela

by using what I call shit-against-the-wall pharmacology,

en utilisant une pharmacologie empirique,

which means, well, let's just throw chemicals at it,

c'est-à-dire qu'on balance des médicaments,

and maybe it's going to make it work.

et on espère que ça marchera.

But if you really understand why does a cell go from normal cell to cancer?

Mais si vous voulez réellement comprendre pourquoi une cellule normale devient cancéreuse...

What is the code?

Quel est le code?

What are the exact instructions that are making it do that?

Quelles ont les instructions précises qui sont données à la cellule pour cela?

then you can go about the process of trying to fix it and figure it out.

Ensuite, vous pouvez envisager de réparer le processus et de le comprendre.

So, for your next dinner over a great bottle of wine, here's a few factoids for you.

Voici, pour votre prochain diner en ville, quelques chiffres.

We actually have about 24,000 genes that do things.

On a 24000 gènes qui font quelque chose.

We have about a hundred, 120,000 others

On en a environ 100, 120000 autres

that don't appear to function every day,

qui ne semblent pas fonctionner tous les jours,

but represent this archival history of how we used to work as a species

mais qui représentent cette archive de notre fonctionnement en tant qu'espèce

going back tens of thousands of years.

depuis des dizaines de milliers d'années.

You might also be interested in knowing

Vous pourriez aussi être intéressés de savoir

that a mouse has about the same amount of genes.

qu'une souris a à peu près le même nombre de gènes.

They recently sequenced Pinot Noir, and it also has about 30,000 genes,

Le cépage Pinot Noir a été récemment séquencé. Il contient aussi 30000 gènes,

so the number of genes you have may not necessarily represent the complexity

le nombres de gènes ne représente donc pas la complexité de l'espèce

or the evolutionary order of any particular species.

ou son niveau d'évolution.

Now, look around: just look next to your neighbor,

Maintenant, regardez votre voisin,

look forward, look backward. We all look pretty different.

regardez devant, derrière. On a tous l'air plutôt différents.

A lot of very handsome and pretty people here, skinny, chubby,

Beaucoup de gens beaux, sveltes, enveloppés,

different races, cultures. We are all 99.9% genetically equal.

de races et de cultures différentes. Nous sommes tous à 99,9% identiques.

It is one one-hundredth of one percent of genetic material

Cela fait 1/100e de 1% de notre matériel génétique

that makes the difference between any one of us.

qui explique les différences entre nous.

That's a tiny amount of material,

Ce n'est pas beaucoup,

but the way that ultimately expresses itself

mais la manière dont nous l'exprimons au final

is what makes changes in humans and in all species.

explique les différences entre humains et dans toutes les espèces.

So, we are now able to read genomes.

Nous sommes capables de lire les génomes.

The first human genome took 10 years, three billion dollars.

Le premier génome humain a pris 10 ans et a coûté 3 milliards de dollars.

It was done by Dr. Craig Venter.

Cela a été accompli par Craig Venter.

And then James Watson's -- one of the co-founders of DNA --

Puis James Watson, un des co-découvreurs de l'ADN,

genome was done for two million dollars, and in just two months.

a séquencé un génome pour un coût de deux millions de dollars, en deux mois.

And if you think about the computer industry

Si vous regardez l'industrie informatique,

and how we've gone from big computers to little ones

comment nous sommes passés de gros ordinateurs à des petits

and how they get more powerful and faster all the time,

et comment leur puissance et leur rapidité ont augmenté,

the same thing is happening with gene sequencing now:

la même chose est en train de se passer pour le séquençage :

we are on the cusp of being able to sequence human genomes

on est sur le point de pouvoir séquencer des génomes humains

for about 5,000 dollars in about an hour or a half-hour;

pour 5000 dollars et en une heure ou une demi-heure;

you will see that happen in the next five years.

cela va arriver dans les cinq prochaines années.

And what that means is, you are going to walk around

Cela veut dire que vous vous baladerez

with your own personal genome on a smart card. It will be here.

avec votre génome sur une carte à puce. Ça va arriver.

And when you buy medicine,

Et quand vous achèterez vos médicaments,

you won't be buying a drug that's used for everybody.

vous n'achèterez plus un médicament prévu pour tous.

You will give your genome to the pharmacist,

Vous donnerez votre génome au pharmacien,

and your drug will be made for you

et le médicament sera fait pour vous.

and it will work much better than the ones that were --

Et il marchera bien mieux que ceux d'aujourd'hui.

you won't have side effects.

Vous n'aurez pas d'effets secondaires.

All those side effects, you know, oily residue and, you know,

Tous ces effets secondaires, les résidus huileux,

whatever they say in those commercials: forget about that.

tout ce dont ils parlent dans les pubs: oubliez tout cela.

They're going to make all that stuff go away.

Ils feront disparaître tout cela.

What does a genome look like?

A quoi ressemble un génome?

Well, there it is. It is a long, long series of these base pairs.

En voilà un. C'est une très longue série de paires de base.

If you saw the genome for a mouse or for a human it would look no different than this,

Regardez le génome d'une souris ou d'un humain, il ne sera pas différent,

but what scientists are doing now is

mais ce que font les scientifiques maintenant,

they're understanding what these do and what they mean.

c'est comprendre ce qu'ils font et ce qu'ils signifient.

Because what Nature is doing is double-clicking all the time.

Parce que la Nature est tout le temps en train de double-cliquer.

In other words, the first couple of sentences here,

En d'autre mots, les premières phrases ici,

assuming this is a grape plant:

en supposant que ce soit une plant de vigne,

make a root, make a branch, create a blossom.

fais une racine, fais une branche, crée un bourgeon.

In a human being, down in here it could be:

Chez un être humain, cela pourrait être :

make blood cells, start cancer.

fais des cellules sanguines, démarre un cancer.

For me it may be: every calorie you consume, you conserve,

Pour moi cela serait : chaque calorie que tu ingères, conserve-la

because I come from a very cold climate.

parce que je viens d'un climat très froid.

For my wife: eat three times as much and you never put on any weight.

Pour ma femme : mange trois fois plus et tu prendras jamais du poids.

It's all hidden in this code,

Tout cela est caché dans ce code,

and it's starting to be understood at breakneck pace.

on commence à le comprendre à un rythme soutenu.

So, what can we do with genomes now that we can read them,

Que pouvons-nous faire des génomes maintenant que nous savons les lire,

now that we're starting to have the book of life?

maintenant que nous avons le livre de la vie?

Well, there's many things. Some are exciting.

Beaucoup de choses. Certaines sont excitantes.

Some people will find very scary. I will tell you a couple of things

Certains pourraient les trouver très effrayantes : je vous dirai des choses

that will probably make you want to projectile puke on me, but that's okay.

qui vous donneront peut-être envie de vomir sur moi, mais vous avez le droit.

So, you know, we now can learn the history of organisms.

Nous pouvons maintenant apprendre l'histoire des organismes.

You can do a very simple test: scrape your cheek; send it off.

Faites un test très simple : prenez des cellules de votre bouche et envoyez-les.

You can find out where your relatives come from;

Vous pourrez savoir d'où viennent vos ancêtres;

you can do your genealogy going back thousands of years.

vous pourrez faire remonter votre généalogie sur des milliers d'années.

We can understand functionality. This is really important.

On peut comprendre la fonctionnalité. Ceci est très important.

We can understand, for example, why we create plaque in our arteries,

On peut comprendre, par exemple, pourquoi des plaques se créent dans les artères,

what creates the starchiness inside of a grain,

ce qui crée l'amertume dans une graine,

why does yeast metabolize sugar and produce carbon dioxide.

pourquoi la levure métabolise le sucre et produit du dioxyde de carbone.

We can also look at, at a grander scale, what creates problems,

On peut aussi étudier à plus grande échelle la source de problèmes,

what creates disease, and how we may be able to fix them.

ce qui crée des maladies et comment on pourrait les soigner.

Because we can understand this,

Puisque nous pouvons comprendre ces problèmes,

we can fix them, make better organisms.

on peut les résoudre et créer des organismes meilleurs.

Most importantly, what we're learning

Encore plus important : nous apprenons

is that Nature has provided us a spectacular toolbox.

que la Nature nous a donné une boite à outils incroyable.

The toolbox exists.

Cette boite à outils existe.

An architect far better and smarter than us has given us that toolbox,

Un architecte bien meilleur et bien plus intelligent que nous, nous l'a donnée,

and we now have the ability to use it.

et maintenant nous avons les capacités pour l'utiliser.

We are now not just reading genomes; we are writing them.

Nous ne faisons pas que lire les génomes, nous les écrivons.

This company, Synthetic Genomics, I'm involved with,

"Synthetic Genomics", la société dans laquelle je suis impliqué,

created the first full synthetic genome for a little bug,

a créé le premier génome synthétique d'une bactérie,

a very primitive creature called Mycoplasma genitalium.

une créature très primitive appelée Mycoplasma genitalium.

If you have a UTI, you've probably -- or ever had a UTI --

Si vous avez une infection urinaire, probablement que -- plutôt si vous en avez eu une un jour --

you've come in contact with this little bug.

vous avez été en contact avec cette bactérie.

Very simple -- only has about 246 genes --

Très simple, seulement 246 gènes,

but we were able to completely synthesize that genome.

nous avons été capables de synthétiser son génome.

Now, you have the genome and you say to yourself,

Maintenant que l'on a le génome, on se dit :

So, if I plug this synthetic genome -- if I pull the old one out and plug it in --

si je place ce génome synthétique -- si je remplace l'ancien et met le nouveau --

does it just boot up and live?

est-ce que la bactérie va naître et vivre?

Well, guess what. It does.

Vous savez quoi? Ça marche!

Not only does it do that; if you took the genome -- that synthetic genome --

Mais pas seulement : si on prend le génome -- le génome synthétique --

and you plugged it into a different critter, like yeast,

et qu'on le place dans un autre micro-organisme, disons la levure,

you now turn that yeast into Mycoplasma.

on transforme la levure en mycoplasma.

It's, sort of, like booting up a PC with a Mac O.S. software.

C'est comme si on démarrait un PC avec les logiciels d'Apple.

Well, actually, you could do it the other way.

Eh bien, en fait, on pourrait le faire à l'inverse.

So, you know, by being able to write a genome

Ainsi, en étant capable d'écrire un génome

and plug it into an organism,

et de le transférer dans un autre organisme,

the software, if you will, changes the hardware.

le logiciel, si on veut, change le matériel.

And this is extremely profound.

Cela a beaucoup de conséquences.

So, last year the French and Italians announced

L'année dernière, les Français et les Italiens ont annoncé

they got together and they went ahead and they sequenced Pinot Noir.

qu'ils s'étaient unis et avaient réussi à séquencer le pinot Noir.

The genomic sequence now exists for the entire Pinot Noir organism,

La séquence génomique existe maintenant pour le Pinot Noir,

and they identified, once again, about 29,000 genes.

et ils ont identifié, encore une fois, 29000 gènes.

They have discovered pathways that create flavors,

Ils ont découvert ce qui crée les saveurs,

although it's very important to understand

bien qu'il soit très important de comprendre

that those compounds that it's cranking out

que ces composés qui sont produits

have to match a receptor in our genome, in our tongue,

doivent correspondre à un récepteur situé sur notre langue,

for us to understand and interpret those flavors.

pour que nous soyons capables de déguster les saveurs du vin.

They've also discovered that

Ils ont aussi découvert

there's a heck of a lot of activity going on producing aroma as well.

qu'il y a beaucoup d'activité dans les cellules pour produire les arômes.

They've identified areas of vulnerability to disease.

Ils ont identifié les zones de vulnérabilité aux maladies.

They now are understanding, and the work is going on,

Ils sont maintenant en train de comprendre, et ce travail est en cours,

exactly how this plant works, and we have the capability to know,

comment ces plantes vivent, et on a la capacité

to read that entire code and understand how it ticks.

de lire tout le code et de comprendre comment il fonctionne.

So, then what do you do?

Qu'est-ce que vous faites alors?

Knowing that we can read it, knowing that we can write it, change it,

Sachant que vous le pouvez lire, que vous pouvez l'écrire, le changer

maybe write its genome from scratch. So, what do you do?

on pourrait peut-être en écrire un de but en blanc. Que décidez-vous?

Well, one thing you could do is what some people might call Franken-Noir.

Une chose pourrait être de créer un Franken-Noir, comme certains disent.

(Laughter)

(Rires)

We can build a better vine.

On pourrait élaborer une vigne meilleure.

By the way, just so you know:

Au fait, juste pour votre information

you get stressed out about genetically modified organisms;

si vous stressez au sujet des organismes génétiquement modifiés;

there is not one single vine in this valley or anywhere

il n'y a pas une seule vigne dans la Napa Valley ou ailleurs

that is not genetically modified.

qui ne soit pas génétiquement modifiée.

They're not grown from seeds; they're grafted into root stock;

Elles ne proviennent pas de graines mais de racines greffées;

they would not exist in nature on their own.

elles n'existeraient pas d'elles-mêmes dans la nature.

So, don't worry about, don't stress about that stuff. We've been doing this forever.

Donc ne stressez pas, on fait cela depuis toujours.

So, we could, you know, focus on disease resistance;

On pourrait aussi s'intéresser à la résistance aux pathologies;

we can go for higher yields without necessarily having

on pourrait aussi avoir de meilleurs rendements sans avoir à utiliser

dramatic farming techniques to do it, or costs.

des techniques de production draconiennes, ou sans avoir des coûts exorbitants.

We could conceivably expand the climate window:

On pourrait élargir le spectre de climats possibles:

we could make Pinot Noir grow maybe in Long Island, God forbid.

on pourrait faire pousser du pinot noir sur Long Island, que Dieu nous pardonne.

(Laughter)

(Rires)

We could produce better flavors and aromas.

On pourrait produire des saveurs et des arômes meilleurs.

You want a little more raspberry, a little more chocolate here or there?

Vous voulez un peu plus de mûres, de chocolat ici ou là?

All of these things could conceivably be done,

Toutes ces choses pourraient être faites,

and I will tell you I'd pretty much bet that it will be done.

et je vous le dis, j'en prends le pari : on le fera.

But there's an ecosystem here.

Mais il y a un écosystème.

In other words, we're not, sort of, unique little organisms running around;

En d'autres termes, nous ne sommes pas les seuls organismes dans le coin;

we are part of a big ecosystem.

nous sommes une partie d'un énorme écosystème.

In fact -- I'm sorry to inform you --

En fait -- je suis désolé de vous le dire --

that inside of your digestive tract is about 10 pounds of microbes

à l'intérieur de vos conduits digestifs, il y a environ 5 kg de microbes

which you're circulating through your body quite a bit.

que vous faites pas mal circuler dans notre organisme.

Our ocean's teaming with microbes;

Notre océan grouille de microbes;

in fact, when Craig Venter went and sequenced the microbes in the ocean,

en fait, quand Craig Venter est allé séquencer les microbes dans l'océan,

in the first three months tripled the known species on the planet

en trois mois, il a multiplié par 3 le nombre d'espèces connues sur la planète

by discovering all-new microbes in the first 20 feet of water.

en découvrant les microbes présents dans les dix premiers mètres de profondeur.

We now understand that those microbes have more impact on our climate

Nous savons maintenant que ces microbes ont plus d'impact sur notre climat

and regulating CO2 and oxygen than plants do,

et la régulation du CO2 que les plantes,

which we always thought oxygenate the atmosphere.

dont nous avons toujours pensé qu'elles oxygénaient l'atmosphère.

We find microbial life in every part of the planet:

On trouve de la vie microbienne partout sur la planète:

in ice, in coal, in rocks, in volcanic vents; it's an amazing thing.

dans la glace, le charbon, les rochers, les volcans; c'est étonnant.

But we've also discovered, when it comes to plants, in plants,

Mais puisqu'on parle des plantes, nous avons aussi découvert,

as much as we understand and are starting to understand their genomes,

pour autant que nous comprenions leurs génomes,

it is the ecosystem around them,

qu'il existe un écosystème autour d'elles,

it is the microbes that live in their root systems,

ce sont les microbes vivant dans leurs racines,

that have just as much impact on the character of those plants

qui ont beaucoup d'impact sur leur comportement,

as the metabolic pathways of the plants themselves.

sur les voies métaboliques des plantes elles-mêmes.

If you take a closer look at a root system,

Si vous regardez de plus près les racines d'une plante,

you will find there are many, many, many diverse microbial colonies.

vous allez trouver tout un tas de colonies microbiennes différentes.

This is not big news to viticulturists;

Ce n'est pas une découverte pour les viticulteurs;

they have been, you know, concerned with water and fertilization.

ils ont toujours fait très attention à l'arrosage et à la fertilisation.

And, again, this is, sort of, my notion of shit-against-the-wall pharmacology:

Encore une fois, je reviens sur mon terme de pharmacologie sortie du chapeau:

you know certain fertilizers make the plant more healthy so you put more in.

connaissant un fertilisant qui améliore la pousse de la plante, vous en mettez plus.

You don't necessarily know with granularity

Vous ne savez peut-être pas avec précision

exactly what organisms are providing what flavors and what characteristics.

quels organismes microbiens apportent telle saveur et telle caractéristique.

We can start to figure that out.

On peut commencer à le comprendre.

We all talk about terroir; we worship terroir;

On parle tous de terroir; on vénère le terroir;

we say, Wow, is my terroir great! It's so special.

On dit: mon terroir est super, il est si spécifique.

I've got this piece of land and it creates terroir like you wouldn't believe.

J'ai cette partie de terrain et cela donne un terroir exceptionnel.

Well, you know, we really, we argue and debate about it --

Nous discutons, nous débattons souvent de cela --

we say it's climate, it's soil, it's this. Well, guess what?

on dit :c'est le climat, le sol, c'est ceci. Eh bien, devinez quoi?

We can figure out what the heck terroir is.

On peut comprendre ce qu'est le terroir.

It's in there, waiting to be sequenced.

C'est là-dedans, il n'y a plus qu'à le séquencer.

There are thousands of microbes there.

Il y a des milliers de microbes ici.

They're easy to sequence: unlike a human,

Ils sont faciles à séquencer: contrairement à l'humain,

they, you know, have a thousand, two thousand genes;

ils ont mille, deux mille gènes;

we can figure out what they are.

vous pouvez découvrir ce qu'ils sont.

All we have to do is go around and sample, dig into the ground, find those bugs,

Tout ce qu'il y a à faire, c'est choisir un échantillon, creuser, trouver ces microbes,

sequence them, correlate them to the kinds of characteristics we like and don't like --

les séquencer, les corréler aux caractéristiques que nous apprécions et à celles que nous n'aimons pas --

that's just a big database -- and then fertilize.

c'est juste un grosse base de données -- et enfin fertiliser.

And then we understand what is terroir.

Alors nous aurons compris ce qu'est un terroir.

So, some people will say, Oh, my God, are we playing God?

Certains diront : Oh mon Dieu, nous prenons-nous pour Dieu?

Are we now, if we engineer organisms, are we playing God?

Est-ce que, si nous créons de nouveaux organismes, nous nous prenons pour Dieu?

And, you know, people would always ask James Watson --

Les gens demandent toujours à James Watson --

he's not always the most politically correct guy ...

il n'est pas toujours le gars le plus politiquement correct... --

(Laughter)

(Rires)

... and they would say, "Are, you know, are you playing God?"

ils lui demandent : "Est-ce que vous vous prenez pour Dieu?"

And he had the best answer I ever heard to this question:

Il a la meilleure réponse que j'ai jamais entendue :

"Well, somebody has to."

"Quelqu'un doit bien le faire."

(Laughter)

(Rires)

I consider myself a very spiritual person,

Je me considère comme une personne très religieuse,

and without, you know, the organized religion part,

la religion organisée mise à part,

and I will tell you: I don't believe there's anything unnatural.

je vous dirais : je ne crois pas que qu'il existe quelque chose de non-naturel.

I don't believe that chemicals are unnatural.

Je ne crois pas que les substances chimiques soient non-naturelles.

I told you I'm going to make some of you puke.

Je vous ai dit que j'allais en faire vomir quelques-uns.

It's very simple: we don't invent molecules, compounds.

C'est très simple : nous n'inventons pas de molécules, de composés.

They're here. They're in the universe.

Ils sont là. Ils sont dans l'Univers.

We reorganize things, we change them around,

Nous réorganisons les choses, nous les changeons,

but we don't make anything unnatural.

mais nous ne faisons rien qui ne soit pas naturel.

Now, we can create bad impacts --

Certes, nous pouvons avoir un impact négatif --

we can poison ourselves; we can poison the Earth --

on peut s'empoisonner ou empoisonner notre planète --

but that's just a natural outcome of a mistake we made.

mais c'est juste une conséquence naturelle de notre erreur.

So, what's happening today is, Nature is presenting us with a toolbox,

Ce qui arrive aujourd'hui, c'est que la Nature nous donne une boite à outils,

and we find that this toolbox is very extensive.

nous trouvons que cette boite à outils permet de faire beaucoup de choses.

There are microbes out there that actually make gasoline, believe it or not.

Il y a des microbes qui font du pétrole, croyez-le ou non.

There are microbes, you know -- go back to yeast.

Il y a des microbes qui, -- retournons à la levure.

These are chemical factories;

Ce sont de véritables usines chimiques;

the most sophisticated chemical factories are provided by Nature,

les usines chimiques les plus sophistiquées sont dans la Nature,

and we now can use those.

et nous pouvons maintenant les utiliser.

There also is a set of rules.

Il y a des règles à respecter.

Nature will not allow you to --

La Nature ne permettra pas de --

we could engineer a grape plant, but guess what.

on peut modifier un cépage, mais vous savez quoi?

We can't make the grape plant produce babies.

Nous ne savons jamais faire produire un enfant à ce cépage.

Nature has put a set of rules out there.

La Nature a établi un ensemble de règles.

We can work within the rules; we can't break the rules;

Nous pouvons travailler au sein de ces règles; mais nous ne pouvons pas les violer;

we're just learning what the rules are.

nous apprenons juste ce que sont ces règles.

I just ask the question, if you could cure all disease --

Je pose juste la question : si vous pouviez guérir toutes les maladies --

if you could make disease go away,

si vous pouviez faire disparaître les maladies,

because we understand how it actually works,

parce que nous comprendrions comment elles opèrent,

if we could end hunger by being able to create nutritious, healthy plants

si nous pouvions résoudre la faim dans le monde en créant des plantes nutritives saines

that grow in very hard-to-grow environments,

qui pousseraient dans des environnements hostiles,

if we could create clean and plentiful energy --

si nous pouvions créer une énergie propre à profusion --

we, right in the labs at Synthetic Genomics,

eh bien, à Synthetic Genomics,

have single-celled organisms that are taking carbon dioxide

nous avons des organismes unicellulaires capables de capturer le dioxyde de carbone

and producing a molecule very similar to gasoline.

et de produire une molécule très proche du pétrole.

So, carbon dioxide -- the stuff we want to get rid of -- not sugar, not anything.

Le dioxyde de carbone -- dont nous voulons nous débarrasser -- pas le sucre, rien.

Carbon dioxide, a little bit of sunlight,

Du dioxyde de carbone, un peu de lumière,

you end up with a lipid that is highly refined.

et nous obtenons un produit hautement raffiné.

We could solve our energy problems; we can reduce CO2,;

On pourrait résoudre nos problèmes d'énergie, faire baisser le CO2,

we could clean up our oceans; we could make better wine.

nettoyer nos océans, faire de meilleurs vins.

If we could, would we?

Si nous le pouvions, le ferions-nous?

Well, you know, I think the answer is very simple:

Je crois que la réponse est très simple :

working with Nature, working with this tool set that we now understand,

travailler avec la Nature, travailler avec ces outils que nous comprenons désormais,

is the next step in humankind's evolution.

est l'étape suivante dans l'évolution de l'Humanité.

And all I can tell you is, stay healthy for 20 years.

Tout ce que je peux vous conseiller est de rester en bonne santé pendant encore 20 ans.

If you can stay healthy for 20 years, you'll see 150, maybe 300.

Si vous y arrivez, vous atteindrez l'âge de 150, voire 300 ans.

Thank you.

Merci.